Paket: python-biopython (1.73+dfsg-1)

[ Quellcode: python-biopython  ]

Python-Bibliothek für die Bioinformatik (implementiert in Python 2)

Das Projekt Biopython ist eine internationale Vereinigung von Entwicklern frei verfügbarer Python-Werkzeuge für rechnergestützte Molekularbiologie.

Es ist eine verteilte, gemeinsame Anstrengung zur Entwicklung von Python-Bibliotheken und -Applikationen, die auf die Anforderungen der aktuellen und zukünftigen Arbeit in der Bioinformatik zugeschnitten sind. Der Quelltext ist unter der »Biopython License« verfügbar, welche sehr liberal ist und kompatibel mit fast jeder Lizenz. Das Projekt arbeitet gemeinsam mit der Open Bioinformatics Foundation, die für das Projekt Speicherplatz für CVS und für die Webseiten bereitstellt.

Dieses Paket ist für die Python-Version 2 zuständig.

Markierungen: Software-Entwicklung: Python-Entwicklung, Bibliotheken, Feld: field::biology, field::biology:bioinformatics, Implementiert in: Python, Rolle: role::devel-lib, role::shared-lib

Andere Pakete mit Bezug zu python-biopython

• dep: libc6 (>= 2.4)

  GNU-C-Bibliothek: Laufzeitbibliotheken
  auch ein virtuelles Paket, bereitgestellt durch libc6-udeb

• dep: python

  Interaktive objektorientierte Hochsprache (Python2-Version)

  dep: python (<< 2.8)

  dep: python (>= 2.7~)

• dep: python-numpy (>= 1:1.16.0~rc1)

  Numerical Python fügt der Sprache Python eine schnelle Array-Einrichtung hinzu

• dep: python-numpy-abi9

  virtuelles Paket, bereitgestellt durch python-numpy

• dep: python-reportlab

  Python-Bibliothek zur Erzeugung von PDF-Dokumenten

• rec: ncbi-blast+

  next generation suite of BLAST sequence search tools

• rec: python-biopython-doc (= 1.73+dfsg-1)

  Dokumentation für die Biopython-Bibliothek

• sug: clustalo

  Universalprogramm für multiple Sequenzalignments (MSA) von Proteinen

• sug: clustalw

  Globale multiple Alignments von Nukleotid- oder Peptidsequenzen

• sug: dialign

  Segmentbasiertes multiples Sequenzalignment

• sug: dssp

  Sekundärstruktur-Zuordnung bei Proteinen, basierend auf 3D-Struktur

• sug: emboss

  Europäische, quelloffene Software-Suite für Molekularbiologie

• sug: fasttree

  phylogenetic trees from alignments of nucleotide or protein sequences

• sug: mafft

  Programm für multiples Alignment von Aminosäure- oder Nukleotidsequenzen

• sug: muscle

  Programm zur Ausrichtung mehrerer Proteinsequenzen

• sug: phylip

  package of programs for inferring phylogenies

• sug: phyml

  Phylogenetic estimation using Maximum Likelihood

• sug: prank

  Probabilistic Alignment Kit for DNA, codon and amino-acid sequences

• sug: probcons

  PROBabilistic CONSistency-based multiple sequence alignment

• sug: python-matplotlib

  Python-System ähnlich Matlab zur Ausgabe von Zeichnungen

• sug: python-mysqldb

  Python-Schnittstelle zu MySQL

• sug: python-pil

  Python-Bildbearbeitungsbibliothek (Pillow-Fork)

• sug: python-psycopg2

  Python-Modul für PostgreSQL

• sug: python-rdflib (>= 4)

  Python-RDF-Bibliothek für Speicherung, Auswertung und Serialisierung

• sug: python-renderpm

  Python-Schnittstelle für Low Level Rendering

• sug: python-scipy

  wissenschaftliche Werkzeuge für Python

• sug: python-tk

  Tkinter - Schreiben von Tk-Anwendungen mit Python2

• sug: raxml

  Randomized Axelerated Maximum Likelihood of phylogenetic trees

• sug: samtools

  processing sequence alignments in SAM, BAM and CRAM formats

• sug: t-coffee

  Multiple Sequence Alignment

• sug: w3-dtd-mathml

  Mathematical Markup Language V2.0 DTD

• sug: wise (>= 2.4.1-16)

  Vergleich biologischer Polymere, wie DNA- und Protein-Sequenzen

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Architektur	Paketgröße	Größe (installiert)	Dateien
armhf	1.282,2 kB	8.822,0 kB	[Liste der Dateien]