Package: r-cran-ape (5.4-1-1)

[ Source: r-cran-ape  ]

pacchetto GNU R per analisi su filogenesi ed evoluzione

Questo pacchetto fornisce funzioni per leggere, scrivere, disegnare e manipolare alberi filogenetici, analisi di dati comparativi in un'infrastruttura filogenetica, analisi di caratteri ancestrali, analisi di diversificazione e macroevoluzione, calcoli di distanze da sequenze di DNA, lettura e scrittura di sequenze nucleotidiche oltre all'importazione da BioConductor e svariati strumenti come il test di Mantel, grafici skyline generalizzati, esplorazioni grafiche di dati filogenetici (alex, trex, kronoviz), stime di tassi evolutivi assoluti e alberi in stile orologio usando lunghezze di percorsi medi e verosimiglianza con penalità, traduzione di DNA in sequenze di AA e valutazione di allineamenti di sequenze. Le stime filogenetiche possono essere fatte con i metodi NJ, BIONJ, ME, MVR, SDM e triangolare e svariati metodi gestiscono matrici di distanze non complete (NJ*, BIONJ*, MVR* e il corrispondente metodo triangolare). Alcune funzioni chiamano applicazioni esterne (PhyML, Clustal, T-Coffee, Muscle) i cui risultati vengono restituiti ad R.

Tags: Software Development: GNU R Development, Field: Statistics, Implemented in: GNU R

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Architecture	Package Size	Installed Size	Files
amd64	2,156.2 kB	2,509.0 kB	[list of files]
arm64	2,142.3 kB	2,481.0 kB	[list of files]
armel	2,140.1 kB	2,478.0 kB	[list of files]
armhf	2,137.5 kB	2,399.0 kB	[list of files]
i386	2,157.7 kB	2,503.0 kB	[list of files]
mips64el	2,145.1 kB	2,528.0 kB	[list of files]
mipsel	2,146.3 kB	2,514.0 kB	[list of files]
ppc64el	2,165.8 kB	2,565.0 kB	[list of files]
s390x	2,150.5 kB	2,529.0 kB	[list of files]