Package: libhts3 (1.16+ds-3)

[ Source: htslib  ]

libreria C per formati di dati di sequenziamento ad alte prestazioni

HTSlib è un'implementazione di una libreria C unificata per l'accesso a formati di file, come SAM (Sequence Alignment/Map), CRAM e VCF (Variant Call Format), comunemente usati per dati di sequenziamento ad alte prestazioni ed è la libreria principale utilizzata da samtools e bcftools. HTSlib dipende solamente da zlib. È noto che è compatibile con gcc, g++ e clang.

HTSlib implementa un indice BAM (SAM binario) generalizzato, con l'estensione di file "csi" (coordinate-sorted index). Il lettore di file HTSlib cerca prima il nuovo indice e poi quello vecchio, se il nuovo è assente.

Tags: Role: Shared Library

Other Packages Related to libhts3

• dep: libbz2-1.0

  libreria compressione file a ordinamento blocchi di alta qualità - runtime

• dep: libc6 (>= 2.34)

  Libreria C GNU: librerie condivise
  also a virtual package provided by libc6-udeb

• dep: libcurl3-gnutls (>= 7.18.0)

  libreria lato client facile da usare per il trasferimento di URL (versione GnuTLS)

• dep: libdeflate0 (>= 1.0)

  compressione e decompressione veloci di buffer interi basate su DEFLATE

• dep: libhtscodecs2 (>= 1.3.0)

  Custom compression for CRAM and others

• dep: liblzma5 (>= 5.1.1alpha+20120614)

  libreria per compressione in formato XZ

• dep: libssl3 (>= 3.0.0)

  toolkit Secure Sockets Layer - librerie condivise

• dep: zlib1g (>= 1:1.1.4)

  libreria di compressione - runtime

Download libhts3

Download for all available architectures

Architecture	Package Size	Installed Size	Files
amd64	419.5 kB	1,044.0 kB	[list of files]
arm64	382.7 kB	1,188.0 kB	[list of files]
armel	363.8 kB	1,123.0 kB	[list of files]
armhf	366.2 kB	931.0 kB	[list of files]
i386	458.0 kB	1,151.0 kB	[list of files]
mips64el	377.8 kB	1,301.0 kB	[list of files]
mipsel	393.9 kB	1,293.0 kB	[list of files]
ppc64el	453.9 kB	1,511.0 kB	[list of files]
s390x	381.5 kB	1,076.0 kB	[list of files]