Paquet source : unicycler (0.5.1+dfsg-1.1)
Liens pour unicycler
Ressources Debian :
Responsables :
Ressources externes :
Les paquets binaires suivants sont compilés à partir de ce paquet source :
- unicycler
- pipeline d’assemblage hybride pour des génomes bactériens
- unicycler-data
- hybrid assembly pipeline for bacterial genomes (data package)
Autres paquets associés à unicycler
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- adep:
debhelper-compat
(= 13)
- Paquet indisponible
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- adep:
dh-sequence-python3
- paquet virtuel fourni par
dh-python
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- adep:
python3-all
- paquet dépendant de toutes les versions d'exécutables prises en charge par Python 3
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- adep:
python3-setuptools
- Améliorations de Python3 Distutils
-
- adep:
default-jdk
- kit de développement Java standard ou compatible
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- adep:
bcftools
- appel de variantes génomiques et manipulation de fichiers VCF et BCF
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- adep:
bowtie2
- aligneur ultra-rapide de lectures courtes avec une faible empreinte mémoire
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- adep:
miniasm
- assembleur de novo très rapide pour des lectures longues de séquences d’ADN bruitées
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- adep:
ncbi-blast+
- suite d'outils de recherche de séquences BLAST de dernière génération
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- adep:
pilon
- automated genome assembly improvement and variant detection tool
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- adep:
racon
- consensus module for raw de novo DNA assembly of long uncorrected reads
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- adep:
samtools
- traitement d'alignements de séquence pour les formats SAM et BAM et CRAM
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- adep:
spades
(>= 3.14)
- assembleur génomique pour des ensembles de données de « single-cell » et « isolates »
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- adep:
libseqan2-dev
- C++ library for the analysis of biological sequences (development)
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- adep:
zlib1g-dev
- bibliothèque de compression — paquet de développement
