Paquet : unikmer (0.19.1-1 et autres)

[ Paquet source : unikmer  ]

Toolkit for nucleic acid k-mer analysis

unikmer is a golang package and a toolkit for nucleic acid k-mer analysis, providing functions including set operation k-mers optional with TaxIDs but without count information.

K-mers are either encoded (k<=32) or hashed (arbitrary k) into uint64, and serialized in binary file with extension .unik.

TaxIDs can be assigned when counting k-mers from genome sequences, and LCA (Lowest Common Ancestor) is computed during set opertions including computing union, intersecton, set difference, unique and repeated k-mers.

Autres paquets associés à unikmer

• dep: libc6 (>= 2.34)

  bibliothèque C GNU : bibliothèques partagées
  un paquet virtuel est également fourni par libc6-udeb

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Architecture	Version	Taille du paquet	Espace occupé une fois installé	Fichiers
amd64	0.19.1-1+b3	2 467,7 ko	7 867,0 ko	[liste des fichiers]
arm64	0.19.1-1+b3	2 114,2 ko	7 483,0 ko	[liste des fichiers]
armel	0.19.1-1+b3	2 124,9 ko	7 372,0 ko	[liste des fichiers]
armhf	0.19.1-1+b3	2 116,2 ko	7 336,0 ko	[liste des fichiers]
i386	0.19.1-1+b3	2 311,2 ko	7 426,0 ko	[liste des fichiers]
mips64el	0.19.1-1+b3	1 914,7 ko	8 526,0 ko	[liste des fichiers]
mipsel	0.19.1-1+b3	1 958,0 ko	8 248,0 ko	[liste des fichiers]
ppc64el	0.19.1-1+b3	2 065,4 ko	7 547,0 ko	[liste des fichiers]
s390x	0.19.1-1+b3	2 243,3 ko	8 127,0 ko	[liste des fichiers]