Paquet : r-bioc-glmgampoi (1.16.0+dfsg-1 et autres)

[ Paquet source : r-bioc-glmgampoi  ]

GNU R fit a Gamma-Poisson generalized linear model

Fit linear models to overdispersed count data. The package can estimate the overdispersion and fit repeated models for matrix input. It is designed to handle large input datasets as they typically occur in single cell RNA-seq experiments.

Autres paquets associés à r-bioc-glmgampoi

• dep: libblas3

  implémentation de référence en algèbre linéaire de base - bibliothèque partagée

  ou libblas.so.3

  paquet virtuel fourni par libatlas3-base, libblas3, libblis4-openmp, libblis4-pthread, libblis4-serial, libopenblas0-openmp, libopenblas0-pthread, libopenblas0-serial

• dep: libc6 (>= 2.27) [riscv64]

  bibliothèque C GNU : bibliothèques partagées
  un paquet virtuel est également fourni par libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.29) [non alpha, ia64, riscv64, sh4]

  dep: libc6 (>= 2.37) [sh4]

• dep: libc6.1 (>= 2.29) [alpha]

  bibliothèque C GNU : bibliothèques partagées
  un paquet virtuel est également fourni par libc6.1-udeb

  dep: libc6.1 (>= 2.37) [ia64]

• dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [non hppa, ia64, m68k, sh4]

  bibliothèque de prise en charge de GCC

  dep: libgcc-s1 (>= 3.3.4) [sh4]

  dep: libgcc-s1 (>= 4.2) [ia64]

• dep: libgcc-s2 (>= 4.2.1) [m68k]

  bibliothèque de prise en charge de GCC

• dep: libgcc-s4 (>= 4.1.1) [hppa]

  bibliothèque de prise en charge de GCC

• dep: libgfortran5 (>= 8) [sparc64]

  bibliothèque d'exécution pour les applications Fortran GNU

• dep: liblapack3

  bibliothèque de routines algébriques version⋅3 –⋅version partagée

  ou liblapack.so.3

  paquet virtuel fourni par libatlas3-base, liblapack3, libopenblas0-openmp, libopenblas0-pthread, libopenblas0-serial

• dep: libstdc++6 (>= 13.1) [hppa, ia64, m68k, sh4, x32]

  bibliothèque standard C++ de GNU v3

  dep: libstdc++6 (>= 14) [non hppa, ia64, m68k, sh4, x32]

• dep: libunwind8 [ia64]

  bibliothèque pour déterminer la chaîne d'appel d'un programme –⋅exécutable

• dep: r-api-4.0

  paquet virtuel fourni par r-base-core

• dep: r-api-bioc-3.18 [hppa, ia64, m68k, sh4, x32]

  Paquet indisponible

• dep: r-api-bioc-3.19 [non hppa, ia64, m68k, sh4, x32]

  paquet virtuel fourni par r-bioc-biocgenerics

• dep: r-bioc-beachmat [hppa, ia64, m68k, sh4, x32]

  E/S pour plusieurs formats de stockage de données de matrice

  dep: r-bioc-beachmat (>= 2.20.0) [non hppa, ia64, m68k, sh4, x32]

• dep: r-bioc-biocgenerics [hppa, ia64, m68k, sh4, x32]

  generic functions for Bioconductor

  dep: r-bioc-biocgenerics (>= 0.50.0) [non hppa, ia64, m68k, sh4, x32]

• dep: r-bioc-delayedarray [hppa, ia64, m68k, sh4, x32]

  BioConductor delayed operations on array-like objects

  dep: r-bioc-delayedarray (>= 0.30.1) [non hppa, ia64, m68k, sh4, x32]

• dep: r-bioc-delayedmatrixstats [hppa, ia64, m68k, sh4, x32]

  fonctions pour les lignes et les colonnes des objets « DelayedMatrix »

  dep: r-bioc-delayedmatrixstats (>= 1.26.0) [non hppa, ia64, m68k, sh4, x32]

• dep: r-bioc-hdf5array [hppa, ia64, m68k, sh4, x32]

  HDF5 backend for DelayedArray objects

  dep: r-bioc-hdf5array (>= 1.32.0) [non hppa, ia64, m68k, sh4, x32]

• dep: r-bioc-matrixgenerics [hppa, ia64, m68k, sh4, x32]

  S4 Generic Summary Statistic Functions that Operate on Matrix-Like Objects

  dep: r-bioc-matrixgenerics (>= 1.16.0) [non hppa, ia64, m68k, sh4, x32]

• dep: r-bioc-singlecellexperiment [hppa, ia64, m68k, sh4, x32]

  S4 Classes for Single Cell Data

  dep: r-bioc-singlecellexperiment (>= 1.26.0) [non hppa, ia64, m68k, sh4, x32]

• dep: r-bioc-summarizedexperiment [hppa, ia64, m68k, sh4, x32]

  BioConductor assay container

  dep: r-bioc-summarizedexperiment (>= 1.34.0) [non hppa, ia64, m68k, sh4, x32]

• dep: r-cran-matrixstats

  GNU R methods that apply to rows and columns of a matrix

• dep: r-cran-rcpp

  GNU R package for Seamless R and C++ Integration

• dep: r-cran-rcpparmadillo

  GNU R package for Armadillo C++ linear algebra library

• dep: r-cran-rlang

  Functions for Base Types and Core R and 'Tidyverse' Features

• dep: r-cran-vctrs

  GNU R vector helpers

• sug: r-bioc-biocparallel [hppa, ia64, sh4, x32]

  BioConductor facilities for parallel evaluation

  sug: r-bioc-biocparallel (>= 1.38.0) [non hppa, ia64, m68k, sh4, x32]

• sug: r-bioc-biocstyle [hppa, ia64, m68k, sh4, x32]

  standard styles for vignettes and other Bioconductor documents

  sug: r-bioc-biocstyle (>= 2.32.1) [non hppa, ia64, m68k, sh4, x32]

• sug: r-bioc-deseq2 [hppa, ia64, sh4, x32]

  R package for RNA-Seq Differential Expression Analysis

  sug: r-bioc-deseq2 (>= 1.44.0) [non hppa, ia64, m68k, sh4, x32]

• sug: r-bioc-edger [hppa, ia64, m68k, sh4, x32]

  analyse empirique de données numériques d’expressions de gène avec R

  sug: r-bioc-edger (>= 4.2.1) [non hppa, ia64, m68k, sh4, x32]

• sug: r-bioc-limma [hppa, ia64, m68k, sh4, x32]

  modèles linéaires pour des données de biopuce (microarray)

  sug: r-bioc-limma (>= 3.60.4) [non hppa, ia64, m68k, sh4, x32]

• sug: r-bioc-scran [hppa, ia64, sh4, x32]

  méthodes de BioConductor pour l’analyse de données de séquençage d’ARN de cellule unique

  sug: r-bioc-scran (>= 1.32.0) [non hppa, ia64, m68k, sh4, x32]

• sug: r-cran-bench

  High Precision Timing of R Expressions

• sug: r-cran-dplyr

  GNU R grammar of data manipulation

• sug: r-cran-ggplot2

  implementation of the Grammar of Graphics

• sug: r-cran-knitr

  GNU R package for dynamic report generation using Literate Programming

• sug: r-cran-mass

  paquet GNU R pour MASS de Venables et Ripley

• sug: r-cran-matrix

  paquet de GNU R de classes pour les matrices denses et creuses

• sug: r-cran-rmarkdown

  convert R markdown documents into a variety of formats

• sug: r-cran-statmod

  GNU R package providing algorithms and functions for statistical modeling

• sug: r-cran-testthat (>= 2.1.0)

  GNU R testsuite

• sug: r-cran-zoo

  paquet de GNU R pour des observations totalement ordonnées et indexées

Télécharger r-bioc-glmgampoi

Télécharger pour toutes les architectures proposées

Architecture	Version	Taille du paquet	Espace occupé une fois installé	Fichiers
alpha (portage non officiel)	1.16.0+dfsg-1	1 225,9 ko	2 474,0 ko	[liste des fichiers]
amd64	1.16.0+dfsg-1	1 241,8 ko	2 374,0 ko	[liste des fichiers]
arm64	1.16.0+dfsg-1	1 214,0 ko	2 410,0 ko	[liste des fichiers]
hppa (portage non officiel)	1.14.3+dfsg-1	1 222,0 ko	2 409,0 ko	[liste des fichiers]
ia64 (portage non officiel)	1.14.3+dfsg-1	1 244,8 ko	2 827,0 ko	[liste des fichiers]
m68k (portage non officiel)	1.14.3+dfsg-1	1 213,9 ko	2 300,0 ko	[liste des fichiers]
mips64el	1.16.0+dfsg-1	1 212,6 ko	2 518,0 ko	[liste des fichiers]
ppc64 (portage non officiel)	1.16.0+dfsg-1	1 238,4 ko	2 543,0 ko	[liste des fichiers]
ppc64el	1.16.0+dfsg-1	1 236,0 ko	2 474,0 ko	[liste des fichiers]
riscv64	1.16.0+dfsg-1	1 240,2 ko	2 256,0 ko	[liste des fichiers]
s390x	1.16.0+dfsg-1	1 236,7 ko	2 394,0 ko	[liste des fichiers]
sh4 (portage non officiel)	1.14.3+dfsg-1	1 251,6 ko	2 403,0 ko	[liste des fichiers]
sparc64 (portage non officiel)	1.16.0+dfsg-1	1 201,5 ko	2 804,0 ko	[liste des fichiers]
x32 (portage non officiel)	1.14.3+dfsg-1	1 225,6 ko	2 292,0 ko	[liste des fichiers]