Paquet : r-bioc-glmgampoi (1.2.0+dfsg-6)

[ Paquet source : r-bioc-glmgampoi  ]

GNU R fit a Gamma-Poisson generalized linear model

Fit linear models to overdispersed count data. The package can estimate the overdispersion and fit repeated models for matrix input. It is designed to handle large input datasets as they typically occur in single cell RNA-seq experiments.

Autres paquets associés à r-bioc-glmgampoi

• dep: libblas3

  implémentation de référence en algèbre linéaire de base - bibliothèque partagée

  ou libblas.so.3

  paquet virtuel fourni par libatlas3-base, libblas3, libblis3-openmp, libblis3-pthread, libblis3-serial, libopenblas0-openmp, libopenblas0-pthread, libopenblas0-serial

• dep: libc6 (>= 2.29)

  bibliothèque C GNU : bibliothèques partagées
  un paquet virtuel est également fourni par libc6-udeb

• dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [non armel, armhf]

  bibliothèque de prise en charge de GCC

  dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]

• dep: liblapack3

  bibliothèque de routines algébriques version⋅3 –⋅version partagée

  ou liblapack.so.3

  paquet virtuel fourni par libatlas3-base, liblapack3, libopenblas0-openmp, libopenblas0-pthread, libopenblas0-serial

• dep: libstdc++6 (>= 5.2) [armel, armhf]

  bibliothèque standard C++ de GNU v3

  dep: libstdc++6 (>= 9) [non armel, armhf]

• dep: r-api-4.0

  paquet virtuel fourni par r-base-core

• dep: r-api-bioc-3.12

  paquet virtuel fourni par r-bioc-biocgenerics

• dep: r-base-core (>= 4.0.3-1)

  noyau de GNU R, un système de calculs statistiques et de graphiques

• dep: r-bioc-beachmat

  E/S pour plusieurs formats de stockage de données de matrice

• dep: r-bioc-delayedarray

  BioConductor delayed operations on array-like objects

• dep: r-bioc-delayedmatrixstats

  fonctions pour les lignes et les colonnes des objets « DelayedMatrix »

• dep: r-bioc-hdf5array

  HDF5 backend for DelayedArray objects

• dep: r-bioc-summarizedexperiment

  BioConductor assay container

• dep: r-cran-matrixstats

  GNU R methods that apply to rows and columns of a matrix

• dep: r-cran-rcpp

  GNU R package for Seamless R and C++ Integration

• dep: r-cran-rcpparmadillo

  GNU R package for Armadillo C++ linear algebra library

• rec: r-bioc-deseq2

  R package for RNA-Seq Differential Expression Analysis

• rec: r-bioc-scran

  méthodes de BioConductor pour l’analyse de données de séquençage d’ARN de cellule unique

• rec: r-cran-testthat (>= 2.1.0)

  GNU R testsuite

• rec: r-cran-zoo

  paquet de GNU R pour des observations totalement ordonnées et indexées

• sug: r-bioc-biocparallel

  BioConductor facilities for parallel evaluation

• sug: r-bioc-biocstyle

  standard styles for vignettes and other Bioconductor documents

• sug: r-bioc-edger

  analyse empirique de données numériques d’expressions de gène avec R

• sug: r-bioc-limma

  modèles linéaires pour des données de biopuce (microarray)

• sug: r-cran-bench

  High Precision Timing of R Expressions

• sug: r-cran-ggplot2

  implementation of the Grammar of Graphics

• sug: r-cran-knitr

  GNU R package for dynamic report generation using Literate Programming

• sug: r-cran-mass

  paquet GNU R pour MASS de Venables et Ripley

• sug: r-cran-rmarkdown

  convert R markdown documents into a variety of formats

• sug: r-cran-statmod

  GNU R package providing algorithms and functions for statistical modeling

Télécharger r-bioc-glmgampoi

Télécharger pour toutes les architectures proposées

Architecture	Taille du paquet	Espace occupé une fois installé	Fichiers
amd64	397,1 ko	855,0 ko	[liste des fichiers]
arm64	380,9 ko	839,0 ko	[liste des fichiers]
armel	381,5 ko	805,0 ko	[liste des fichiers]
armhf	380,2 ko	685,0 ko	[liste des fichiers]
i386	408,7 ko	873,0 ko	[liste des fichiers]
mips64el	377,7 ko	978,0 ko	[liste des fichiers]
mipsel	380,2 ko	940,0 ko	[liste des fichiers]
ppc64el	400,6 ko	987,0 ko	[liste des fichiers]
s390x	387,4 ko	887,0 ko	[liste des fichiers]