[ Paquet source : pairtools ]
Paquet : python3-pairtools (1.0.3-1 et autres)
Liens pour python3-pairtools
Ressources Debian :
- Rapports de bogues
- Developer Information
- Journal des modifications Debian
- Fichier de licence
- Suivis des correctifs pour Debian
Télécharger le paquet source pairtools :
Responsables :
Ressources externes :
- Page d'accueil [github.com]
Paquets similaires :
Framework to process sequencing data from a Hi-C experiment
Simple and fast command-line framework to process sequencing data from a Hi-C experiment.
Process pair-end sequence alignments and perform the following operations:
- Detect ligation junctions (a.k.a. Hi-C pairs) in aligned paired-end sequences of Hi-C DNA molecules - Sort .pairs files for downstream analyses - Detect, tag and remove PCR/optical duplicates - Generate extensive statistics of Hi-C datasets - Select Hi-C pairs given flexibly defined criteria - Restore .sam alignments from Hi-C pairs
Autres paquets associés à python3-pairtools
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- dep: cython3 [hppa, ia64, ppc64, sparc64, x32]
- extensions en C pour Python 3
-
- dep: libc6 (>= 2.14) [amd64]
- bibliothèque C GNU : bibliothèques partagées
un paquet virtuel est également fourni par libc6-udeb
- dep: libc6 (>= 2.16) [x32]
- dep: libc6 (>= 2.17) [arm64, ppc64el]
- dep: libc6 (>= 2.27) [riscv64]
- dep: libc6 (>= 2.3.4) [hppa]
- dep: libc6 (>= 2.37) [sh4]
- dep: libc6 (>= 2.4) [armel, armhf, i386, m68k, mips64el, ppc64, sparc64]
-
- dep: libc6.1 (>= 2.33) [ia64]
- bibliothèque C GNU : bibliothèques partagées
un paquet virtuel est également fourni par libc6.1-udeb
- dep: libc6.1 (>= 2.4) [alpha]
-
- dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [alpha, amd64, arm64, i386, mips64el, ppc64el, riscv64, sh4]
- bibliothèque de prise en charge de GCC
- dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]
-
- dep: libgcc-s2 (>= 4.2.1) [m68k]
- bibliothèque de prise en charge de GCC
-
- dep: libstdc++6 (>= 11) [non hppa, ia64, ppc64, sparc64, x32]
- bibliothèque standard C++ de GNU v3
-
- dep: python3
- langage orienté objet interactif de haut niveau – version par défaut de Python 3
- dep: python3 (<< 3.11) [ia64, x32]
- dep: python3 (<< 3.12) [hppa, ppc64, sparc64]
- dep: python3 (<< 3.13) [non hppa, ia64, ppc64, sparc64, x32]
- dep: python3 (>= 3.10~) [hppa, ia64, ppc64, sparc64, x32]
- dep: python3 (>= 3.11~) [m68k, sh4]
- dep: python3 (>= 3.12~) [non hppa, ia64, m68k, ppc64, sh4, sparc64, x32]
-
- dep: python3-bioframe [non hppa, ia64, ppc64, sparc64, x32]
- library to enable flexible, scalable operations on genomic interval dataframes
-
- dep: python3-click
- kit de création d’interface en ligne de commande – Python 3.x
-
- dep: python3-nose [hppa, ia64, ppc64, sparc64, x32]
- test discovery and running for Python3 unittest
-
- dep: python3-numpy (>= 1:1.20.0) [hppa, ia64, ppc64, sparc64, x32]
- gestion rapide des tableaux pour le langage Python – Python 3
- dep: python3-numpy (>= 1:1.22.0) [m68k]
- dep: python3-numpy (>= 1:1.25.0) [non hppa, ia64, m68k, ppc64, sparc64, x32]
-
- dep: python3-numpy-abi9
- paquet virtuel fourni par python3-numpy
-
- dep: python3-pandas [non hppa, ia64, ppc64, sparc64, x32]
- structures de données pour des données « relationnelles » ou « étiquetées »
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- dep: python3-pysam (>= 0.20.0+ds-3~) [non hppa, ia64, ppc64, sparc64, x32]
- interface for the SAM/BAM sequence alignment and mapping format (Python 3)
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- dep: python3-scipy [non hppa, ia64, ppc64, sparc64, x32]
- outils scientifiques pour Python 3
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- dep: python3-yaml [non hppa, ia64, ppc64, sparc64, x32]
- analyseur et générateur de code YAML pour Python3
-
- sug: python3-pairtools-examples (>= 1.0.2)
- Process sequencing data from a Hi-C experiment (examples)
Télécharger python3-pairtools
Architecture | Version | Taille du paquet | Espace occupé une fois installé | Fichiers |
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alpha (portage non officiel) | 1.0.3-1+b1 | 178,1 ko | 895,0 ko | [liste des fichiers] |
amd64 | 1.0.3-1+b2 | 195,4 ko | 796,0 ko | [liste des fichiers] |
arm64 | 1.0.3-1+b1 | 171,4 ko | 892,0 ko | [liste des fichiers] |
armel | 1.0.3-1+b2 | 170,1 ko | 716,0 ko | [liste des fichiers] |
armhf | 1.0.3-1+b2 | 174,4 ko | 624,0 ko | [liste des fichiers] |
hppa (portage non officiel) | 0.3.0-3.2+b2 | 144,6 ko | 640,0 ko | [liste des fichiers] |
i386 | 1.0.3-1+b2 | 193,8 ko | 797,0 ko | [liste des fichiers] |
ia64 (portage non officiel) | 0.3.0-3.2+b1 | 137,3 ko | 612,0 ko | [liste des fichiers] |
m68k (portage non officiel) | 1.0.3-1 | 202,5 ko | 923,0 ko | [liste des fichiers] |
mips64el | 1.0.3-1+b2 | 174,0 ko | 905,0 ko | [liste des fichiers] |
ppc64 (portage non officiel) | 0.3.0-3.2+b2 | 146,6 ko | 752,0 ko | [liste des fichiers] |
ppc64el | 1.0.3-1+b2 | 189,6 ko | 956,0 ko | [liste des fichiers] |
riscv64 | 1.0.3-1+b1 | 182,6 ko | 680,0 ko | [liste des fichiers] |
sh4 (portage non officiel) | 1.0.3-1+b1 | 309,0 ko | 1 152,0 ko | [liste des fichiers] |
sparc64 (portage non officiel) | 0.3.0-3.2+b2 | 125,9 ko | 2 292,0 ko | [liste des fichiers] |
x32 (portage non officiel) | 0.3.0-3.2+b1 | 121,6 ko | 405,0 ko | [liste des fichiers] |