Paquet : python3-pairtools (0.3.0-2 et autres)

[ Paquet source : pairtools  ]

Framework to process sequencing data from a Hi-C experiment

Simple and fast command-line framework to process sequencing data from a Hi-C experiment.

Process pair-end sequence alignments and perform the following operations:

  - Detect ligation junctions (a.k.a. Hi-C pairs) in aligned paired-end
    sequences of Hi-C DNA molecules
  - Sort .pairs files for downstream analyses
  - Detect, tag and remove PCR/optical duplicates
  - Generate extensive statistics of Hi-C datasets
  - Select Hi-C pairs given flexibly defined criteria
  - Restore .sam alignments from Hi-C pairs

Autres paquets associés à python3-pairtools

• dep: cython3

  extensions en⋅C pour Python⋅3

• dep: libc6 (>= 2.14) [amd64]

  bibliothèque C GNU : bibliothèques partagées
  un paquet virtuel est également fourni par libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.17) [arm64, ppc64el]

  dep: libc6 (>= 2.4) [non amd64, arm64, ppc64el]

• dep: python3

  langage orienté objet interactif de haut niveau – version par défaut de Python 3

  dep: python3 (<< 3.10)

  dep: python3 (>= 3.9~)

• dep: python3-click

  Wrapper around optparse for command line utilities - Python 3.x

• dep: python3-nose

  test discovery and running for Python3 unittest

• dep: python3-numpy

  gestion rapide des tableaux avec le langage Python 3

Télécharger python3-pairtools

Télécharger pour toutes les architectures proposées

Architecture	Version	Taille du paquet	Espace occupé une fois installé	Fichiers
amd64	0.3.0-2+b2	121,3 ko	440,0 ko	[liste des fichiers]
arm64	0.3.0-2+b2	110,5 ko	407,0 ko	[liste des fichiers]
armel	0.3.0-2+b2	109,3 ko	394,0 ko	[liste des fichiers]
armhf	0.3.0-2+b2	109,4 ko	342,0 ko	[liste des fichiers]
i386	0.3.0-2+b2	119,7 ko	426,0 ko	[liste des fichiers]
mips64el	0.3.0-2+b2	108,1 ko	437,0 ko	[liste des fichiers]
mipsel	0.3.0-2+b2	108,0 ko	414,0 ko	[liste des fichiers]
ppc64el	0.3.0-2+b2	120,3 ko	479,0 ko	[liste des fichiers]
s390x	0.3.0-2+b2	107,5 ko	415,0 ko	[liste des fichiers]