Paquet : ntcard (1.2.2+dfsg-9)

[ Paquet source : ntcard  ]

Streaming algorithm to estimate cardinality in genomics datasets

As input it takes file(s) in fasta, fastq, sam, or bam formats and computes the total number of distinct k-mers, F0, and also the k-mer coverage frequency histogram, fi, i>=1.

Autres paquets associés à ntcard

• dep: libc6 (>= 2.38)

  bibliothèque C GNU : bibliothèques partagées
  un paquet virtuel est également fourni par libc6-udeb

• dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [non riscv64]

  bibliothèque de prise en charge de GCC

  dep: libgcc-s1 (>= 3.4) [riscv64]

• dep: libgomp1 (>= 6)

  bibliothèque GCC pour OpenMP (GOMP)

• dep: libstdc++6 (>= 14)

  bibliothèque standard C++ de GNU v3

Télécharger ntcard

Télécharger pour toutes les architectures proposées

Architecture	Taille du paquet	Espace occupé une fois installé	Fichiers
amd64	41,2 ko	170,0 ko	[liste des fichiers]
arm64	39,1 ko	218,0 ko	[liste des fichiers]
mips64el	41,0 ko	223,0 ko	[liste des fichiers]
ppc64el	42,8 ko	218,0 ko	[liste des fichiers]
riscv64	40,2 ko	146,0 ko	[liste des fichiers]
s390x	41,1 ko	170,0 ko	[liste des fichiers]