Pacote: unikmer (0.19.1-1 e outros)

[ Fonte: unikmer  ]

Toolkit for nucleic acid k-mer analysis

unikmer is a golang package and a toolkit for nucleic acid k-mer analysis, providing functions including set operation k-mers optional with TaxIDs but without count information.

K-mers are either encoded (k<=32) or hashed (arbitrary k) into uint64, and serialized in binary file with extension .unik.

TaxIDs can be assigned when counting k-mers from genome sequences, and LCA (Lowest Common Ancestor) is computed during set opertions including computing union, intersecton, set difference, unique and repeated k-mers.

Outros pacotes relacionados a unikmer

• dep: libc6 (>= 2.34)

  GNU Biblioteca C: Bibliotecas compartilhadas
  também um pacote virtual fornecido por libc6-udeb

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Arquitetura	Versão	Tamanho do pacote	Tamanho instalado	Arquivos
amd64	0.19.1-1+b3	2,467.7 kB	7,867.0 kB	[lista de arquivos]
arm64	0.19.1-1+b3	2,114.2 kB	7,483.0 kB	[lista de arquivos]
armel	0.19.1-1+b3	2,124.9 kB	7,372.0 kB	[lista de arquivos]
armhf	0.19.1-1+b3	2,116.2 kB	7,336.0 kB	[lista de arquivos]
i386	0.19.1-1+b3	2,311.2 kB	7,426.0 kB	[lista de arquivos]
mips64el	0.19.1-1+b3	1,914.7 kB	8,526.0 kB	[lista de arquivos]
mipsel	0.19.1-1+b3	1,958.0 kB	8,248.0 kB	[lista de arquivos]
ppc64el	0.19.1-1+b3	2,065.4 kB	7,547.0 kB	[lista de arquivos]
s390x	0.19.1-1+b3	2,243.3 kB	8,127.0 kB	[lista de arquivos]