Package: sibelia (3.0.7+dfsg-3)

[ Source: sibelia  ]

strumento per genomica comparativa

Sibelia (Synteny Block ExpLoration tool) è uno strumento per genomica comparativa: assiste i biologi nell'analisi di variazioni genomiche che correlano con patogeni o dei cambiamenti genomici che aiutano i microorganismi ad adattarsi ad ambienti diversi. Sibelia è anche d'aiuto per gli studi evoluzionistici e di riarrangiamento genomico per ceppi multipli di microorganismi.

Sibelia è utile per trovare:

 1) regioni condivise;
 2) regioni che sono presenti in un gruppo di genomi, ma non in altri;
 3) riarrangiamenti che trasformano un genoma in altri genomi.

Other Packages Related to sibelia

• dep: lagan

  strumento estremamente parametrizzabile per allineamento globale di coppia di sequenze genomiche

• dep: libc6 (>= 2.14) [amd64]

  Libreria C GNU: librerie condivise
  also a virtual package provided by libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.17) [arm64, ppc64el]

  dep: libc6 (>= 2.4) [not amd64, arm64, ppc64el]

• dep: libdivsufsort3 (>= 2.0.1)

  fast suffix array construction

• dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [not armel, armhf]

  libreria di supporto a GCC

  dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]

• dep: libstdc++6 (>= 9)

  libreria GNU Standard C++, versione 3

• dep: python3

  interactive high-level object-oriented language (default python3 version)

• sug: sibelia-examples

  strumento per genomica comparativa (dati d'esempio)

Download sibelia

Download for all available architectures

Architecture	Package Size	Installed Size	Files
amd64	309.7 kB	1,176.0 kB	[list of files]
arm64	278.3 kB	1,120.0 kB	[list of files]
armel	283.4 kB	1,139.0 kB	[list of files]
armhf	289.5 kB	955.0 kB	[list of files]
i386	312.3 kB	1,151.0 kB	[list of files]
mips64el	278.1 kB	1,250.0 kB	[list of files]
mipsel	276.8 kB	1,261.0 kB	[list of files]
ppc64el	305.1 kB	1,228.0 kB	[list of files]
s390x	275.7 kB	1,128.0 kB	[list of files]