Paketti: ntcard (1.2.2+dfsg-9)

[ Source: ntcard  ]

Streaming algorithm to estimate cardinality in genomics datasets

As input it takes file(s) in fasta, fastq, sam, or bam formats and computes the total number of distinct k-mers, F0, and also the k-mer coverage frequency histogram, fi, i>=1.

Muut pakettiin ntcard liittyvät paketit

• dep: libc6 (>= 2.38)

  GNU-C-kirjasto: jaetut kirjastot
  myös näennäispaketti, jonka toteuttaa libc6-udeb

• dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [ei riscv64]

  GCC:n apukirjasto

  dep: libgcc-s1 (>= 3.4) [riscv64]

• dep: libgomp1 (>= 6)

  GCC OpenMP (GOMP) support library

• dep: libstdc++6 (>= 14)

  GNU standardi C++ -kirjasto, versio 3

Imuroi ntcard

Imurointi kaikille saataville arkkitehtuureille

Arkkitehtuuri	Paketin koko	Koko asennettuna	Tiedostot
amd64	41.2 kt	170.0 kt	[tiedostoluettelo]
arm64	39.1 kt	218.0 kt	[tiedostoluettelo]
mips64el	41.0 kt	223.0 kt	[tiedostoluettelo]
ppc64el	42.8 kt	218.0 kt	[tiedostoluettelo]
riscv64	40.2 kt	146.0 kt	[tiedostoluettelo]
s390x	41.1 kt	170.0 kt	[tiedostoluettelo]