Paket: spoa (4.0.7+ds-1 ve diğerleri)

[ Kaynak: spoa  ]

SIMD partial order alignment tool

Spoa (SIMD POA) is a c++ implementation of the partial order alignment (POA) algorithm (as described in 10.1093/bioinformatics/18.3.452) which is used to generate consensus sequences (as described in 10.1093/bioinformatics/btg109). It supports three alignment modes: local (Smith-Waterman), global (Needleman-Wunsch) and semi-global alignment (overlap).

spoa ile İlgili Diğer Paketler

• dep: libc6 (>= 2.14) [amd64]

  GNU C Library: Shared libraries
  ayrıca şunun tarafından sağlanan bir sanal paket libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.17) [arm64, ppc64el]

  dep: libc6 (>= 2.4) [amd64, arm64, ppc64el değil]

• dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [armel, armhf değil]

  GCC support library

  dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]

• dep: libspoa7.0.0 (>= 4.0.5+ds) [amd64]

  SIMD partial order alignment library

  dep: libspoa7.0.0 (>= 4.0.7+ds) [amd64 değil]

• dep: libstdc++6 (>= 5.2)

  GNU Standard C++ Library v3

• dep: zlib1g (>= 1:1.1.4)

  compression library - runtime

spoa indir

Tüm mevcut mimariler için indir

Mimari	Sürüm	Paket Boyutu	Kurulu Boyut	Dosyalar
amd64	4.0.7+ds-1+b1	37,1 kB	79,0 kB	[dosya listesi]
arm64	4.0.7+ds-1+b1	35,9 kB	75,0 kB	[dosya listesi]
armel	4.0.7+ds-1+b1	34,9 kB	74,0 kB	[dosya listesi]
armhf	4.0.7+ds-1+b1	34,4 kB	62,0 kB	[dosya listesi]
i386	4.0.7+ds-1+b1	37,8 kB	78,0 kB	[dosya listesi]
mips64el	4.0.7+ds-1+b1	36,7 kB	85,0 kB	[dosya listesi]
mipsel	4.0.7+ds-1+b1	36,3 kB	80,0 kB	[dosya listesi]
ppc64el	4.0.7+ds-1+b1	38,0 kB	99,0 kB	[dosya listesi]
s390x	4.0.7+ds-1+b1	36,0 kB	79,0 kB	[dosya listesi]