[ Källkod: spoa ]
Paket: spoa (4.0.7+ds-1 och andra)
Länkar för spoa
Debianresurser:
Hämta källkodspaketet spoa:
Ansvariga:
Externa resurser:
- Hemsida [github.com]
Liknande paket:
SIMD partial order alignment tool
Spoa (SIMD POA) is a c++ implementation of the partial order alignment (POA) algorithm (as described in 10.1093/bioinformatics/18.3.452) which is used to generate consensus sequences (as described in 10.1093/bioinformatics/btg109). It supports three alignment modes: local (Smith-Waterman), global (Needleman-Wunsch) and semi-global alignment (overlap).
Andra paket besläktade med spoa
|
|
|
|
-
- dep: libc6 (>= 2.14) [amd64]
- GNU C-bibliotek: Delade bibliotek
också ett virtuellt paket som tillhandahålls av libc6-udeb
- dep: libc6 (>= 2.17) [arm64, ppc64el]
- dep: libc6 (>= 2.4) [ej amd64, arm64, ppc64el]
-
- dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [ej armel, armhf]
- GCC stödbibliotek
- dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]
-
- dep: libspoa7.0.0 (>= 4.0.5+ds) [amd64]
- SIMD partial order alignment library
- dep: libspoa7.0.0 (>= 4.0.7+ds) [ej amd64]
-
- dep: libstdc++6 (>= 5.2)
- GNU standardbibliotek v3 för C++
-
- dep: zlib1g (>= 1:1.1.4)
- Kompressionsbibliotek - körtidspaket
Hämta spoa
Arkitektur | Version | Paketstorlek | Installerad storlek | Filer |
---|---|---|---|---|
amd64 | 4.0.7+ds-1+b1 | 37,1 kbyte | 79,0 kbyte | [filförteckning] |
arm64 | 4.0.7+ds-1+b1 | 35,9 kbyte | 75,0 kbyte | [filförteckning] |
armel | 4.0.7+ds-1+b1 | 34,9 kbyte | 74,0 kbyte | [filförteckning] |
armhf | 4.0.7+ds-1+b1 | 34,4 kbyte | 62,0 kbyte | [filförteckning] |
i386 | 4.0.7+ds-1+b1 | 37,8 kbyte | 78,0 kbyte | [filförteckning] |
mips64el | 4.0.7+ds-1+b1 | 36,7 kbyte | 85,0 kbyte | [filförteckning] |
mipsel | 4.0.7+ds-1+b1 | 36,3 kbyte | 80,0 kbyte | [filförteckning] |
ppc64el | 4.0.7+ds-1+b1 | 38,0 kbyte | 99,0 kbyte | [filförteckning] |
s390x | 4.0.7+ds-1+b1 | 36,0 kbyte | 79,0 kbyte | [filförteckning] |