Paketti: spaln (2.4.1+dfsg-3)

[ Source: spaln  ]

splicing-aware transcript-alignment to genomic DNA

Spaln (space-efficient spliced alignment) is a stand-alone program that maps and aligns a set of cDNA or protein sequences onto a whole genomic sequence in a single job. It also performs spliced or ordinary alignment after rapid similarity search against a protein sequence database, if a genomic segment or an amino acid sequence is given as a query.

spaln supports a combination of protein sequence database and a given genomic segment and performs rapid similarity searches and (semi-)global alignments of a set of protein sequence queries against a protein sequence database. Spaln adopts multi-phase heuristics that makes it possible to perform the job on a conventional personal computer.

Muut pakettiin spaln liittyvät paketit

• dep: libc6 (>= 2.29)

  GNU-C-kirjasto: jaetut kirjastot
  myös näennäispaketti, jonka toteuttaa libc6-udeb

• dep: libgcc-s1 (>= 3.3.1) [ei armel, armhf]

  GCC:n apukirjasto

  dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]

• dep: libstdc++6 (>= 5)

  GNU standardi C++ -kirjasto, versio 3

• dep: spaln-data

  splicing-aware transcript-alignment to genomic DNA (data)

• dep: zlib1g (>= 1:1.2.0.2)

  pakkauskirjaston ajonaikaistiedostot

Imuroi spaln

Imurointi kaikille saataville arkkitehtuureille

Arkkitehtuuri	Paketin koko	Koko asennettuna	Tiedostot
amd64	345.1 kt	855.0 kt	[tiedostoluettelo]
arm64	311.5 kt	775.0 kt	[tiedostoluettelo]
armel	296.6 kt	781.0 kt	[tiedostoluettelo]
armhf	303.3 kt	589.0 kt	[tiedostoluettelo]
i386	349.5 kt	881.0 kt	[tiedostoluettelo]
mips64el	330.2 kt	955.0 kt	[tiedostoluettelo]
mipsel	323.5 kt	895.0 kt	[tiedostoluettelo]
ppc64el	360.1 kt	1,120.0 kt	[tiedostoluettelo]
s390x	349.1 kt	1,003.0 kt	[tiedostoluettelo]