Пакет: spaln (2.4.1+dfsg-3)

[ Източник: spaln  ]

splicing-aware transcript-alignment to genomic DNA

Spaln (space-efficient spliced alignment) is a stand-alone program that maps and aligns a set of cDNA or protein sequences onto a whole genomic sequence in a single job. It also performs spliced or ordinary alignment after rapid similarity search against a protein sequence database, if a genomic segment or an amino acid sequence is given as a query.

spaln supports a combination of protein sequence database and a given genomic segment and performs rapid similarity searches and (semi-)global alignments of a set of protein sequence queries against a protein sequence database. Spaln adopts multi-phase heuristics that makes it possible to perform the job on a conventional personal computer.

Други пакети, свързани с spaln

• dep: libc6 (>= 2.29)

  GNU C Library: Shared libraries
  също и виртуален пакет, предлаган от libc6-udeb

• dep: libgcc-s1 (>= 3.3.1) [не armel, armhf]

  GCC support library

  dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]

• dep: libstdc++6 (>= 5)

  GNU Standard C++ Library v3

• dep: spaln-data

  splicing-aware transcript-alignment to genomic DNA (data)

• dep: zlib1g (>= 1:1.2.0.2)

  compression library - runtime

Изтегляне на spaln

Изтегляне за всички налични архитектури

Архитектура	Големина на пакета	Големина след инсталиране	Файлове
amd64	345,1 кБ	855,0 кБ	[списък на файловете]
arm64	311,5 кБ	775,0 кБ	[списък на файловете]
armel	296,6 кБ	781,0 кБ	[списък на файловете]
armhf	303,3 кБ	589,0 кБ	[списък на файловете]
i386	349,5 кБ	881,0 кБ	[списък на файловете]
mips64el	330,2 кБ	955,0 кБ	[списък на файловете]
mipsel	323,5 кБ	895,0 кБ	[списък на файловете]
ppc64el	360,1 кБ	1 120,0 кБ	[списък на файловете]
s390x	349,1 кБ	1 003,0 кБ	[списък на файловете]