Paket: nast-ier (20101212+dfsg1-5)

[ Källkod: microbiomeutil  ]

NAST-based DNA alignment tool

The NAST-iEr alignment utility aligns a single raw nucleotide sequence against one or more NAST formatted sequences.

The alignment algorithm involves global dynamic programming profile alignment to fixed (NAST-formatted) multiply aligned template sequences without any end-gap penalty.

NAST-iEr is part of the microbiomeutil suite.

Andra paket besläktade med nast-ier

• dep: cdbfasta

  Constant DataBase indexing and retrieval tools for multi-FASTA files

• dep: libc6 (>= 2.17) [arm64, ppc64el]

  GNU C-bibliotek: Delade bibliotek
  också ett virtuellt paket som tillhandahålls av libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.4) [ej arm64, ppc64el]

• dep: microbiomeutil-data

  Reference 16S sequences and NAST-alignments used by microbiomeutil tools

• rec: ncbi-blast+

  next generation suite of BLAST sequence search tools

Hämta nast-ier

Hämtningar för alla tillgängliga arkitekturer

Arkitektur	Paketstorlek	Installerad storlek	Filer
amd64	21,0 kbyte	101,0 kbyte	[filförteckning]
arm64	20,7 kbyte	96,0 kbyte	[filförteckning]
armel	20,3 kbyte	96,0 kbyte	[filförteckning]
armhf	20,1 kbyte	92,0 kbyte	[filförteckning]
i386	21,3 kbyte	100,0 kbyte	[filförteckning]
mips64el	21,4 kbyte	102,0 kbyte	[filförteckning]
mipsel	21,2 kbyte	97,0 kbyte	[filförteckning]
ppc64el	21,9 kbyte	149,0 kbyte	[filförteckning]
s390x	20,9 kbyte	100,0 kbyte	[filförteckning]