Paket: vt (0.57721+ds-3 och andra)

[ Källkod: vt  ]

toolset for short variant discovery in genetic sequence data

vt is a variant tool set that discovers short variants from Next Generation Sequencing data.

Vt-normalize is a tool to normalize representation of genetic variants in the VCF. Variant normalization is formally defined as the consistent representation of genetic variants in an unambiguous and concise way. In vt a simple general algorithm to enforce this is implemented.

Andra paket besläktade med vt

• dep: libc6 (>= 2.34) [ej arm64]

  GNU C-bibliotek: Delade bibliotek
  också ett virtuellt paket som tillhandahålls av libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.38) [arm64]

• dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [ej armel, armhf, riscv64]

  GCC stödbibliotek

  dep: libgcc-s1 (>= 3.4) [riscv64]

  dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]

• dep: libhts3t64 (>= 1.17)

  C library for high-throughput sequencing data formats

• dep: libpcre2-8-0 (>= 10.22)

  New Perl Compatible Regular Expression Library- 8 bit runtime files

• dep: libstdc++6 (>= 13.1)

  GNU standardbibliotek v3 för C++

• dep: r-base-core

  GNU R core of statistical computation and graphics system

Hämta vt

Hämtningar för alla tillgängliga arkitekturer

Arkitektur	Version	Paketstorlek	Installerad storlek	Filer
amd64	0.57721+ds-3+b1	821,5 kbyte	2.902,0 kbyte	[filförteckning]
arm64	0.57721+ds-3+b2	702,6 kbyte	2.706,0 kbyte	[filförteckning]
armel	0.57721+ds-3+b1	637,2 kbyte	2.361,0 kbyte	[filförteckning]
armhf	0.57721+ds-3+b1	657,9 kbyte	1.661,0 kbyte	[filförteckning]
i386	0.57721+ds-3+b1	826,5 kbyte	3.065,0 kbyte	[filförteckning]
mips64el	0.57721+ds-3+b1	604,5 kbyte	3.505,0 kbyte	[filförteckning]
ppc64el	0.57721+ds-3+b1	726,7 kbyte	3.090,0 kbyte	[filförteckning]
riscv64	0.57721+ds-3+b2	803,1 kbyte	2.342,0 kbyte	[filförteckning]
s390x	0.57721+ds-3+b1	757,8 kbyte	2.834,0 kbyte	[filförteckning]