Paket: ataqv (1.3.1+ds-2 und andere)

[ Quellcode: ataqv  ]

ATAC-seq QC and visualization

A toolkit for measuring and comparing ATAC-seq results, made in the Parker lab at the University of Michigan. They wrote it to help understand how well their ATAC-seq assays had worked, and to make it easier to spot differences that might be caused by library prep or sequencing.

Markierungen: GUI-Baukasten: Ncurses TUI

Andere Pakete mit Bezug zu ataqv

• dep: fonts-font-awesome

  Symbol-Schriftart für die Verwendung mit Twitter Bootstrap

• dep: libboost-chrono1.74.0 (>= 1.74.0) [hppa]

  C++-Darstellung von Zeitspannen, Zeitpunkten und Uhren

• dep: libboost-chrono1.83.0t64 (>= 1.83.0) [nicht hppa]

  C++-Darstellung von Zeitspannen, Zeitpunkten und Uhren

• dep: libboost-filesystem1.74.0 (>= 1.74.0) [hppa]

  Dateisystemoperationen (portable Pfade, Iterationen über Verzeichnisse, usw.) in C++

• dep: libboost-filesystem1.83.0 (>= 1.83.0) [nicht hppa]

  Dateisystemoperationen (portable Pfade, Iterationen über Verzeichnisse, usw.) in C++

• dep: libboost-iostreams1.74.0 (>= 1.74.0) [hppa]

  Boost.Iostreams-Bibliothek

• dep: libboost-iostreams1.83.0 (>= 1.83.0) [nicht hppa]

  Boost.Iostreams-Bibliothek

• dep: libc6 (>= 2.32) [hppa]

  GNU-C-Bibliothek: Laufzeitbibliotheken
  auch ein virtuelles Paket, bereitgestellt durch libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.34) [amd64, armel, m68k, mips64el, ppc64el]

  dep: libc6 (>= 2.37) [loong64, sh4]

  dep: libc6 (>= 2.38) [arm64, armhf, i386, riscv64, x32]

• dep: libc6.1 (>= 2.34) [alpha]

  GNU-C-Bibliothek: Laufzeitbibliotheken
  auch ein virtuelles Paket, bereitgestellt durch libc6.1-udeb

  dep: libc6.1 (>= 2.37) [ia64]

• dep: libgcc-s1 (>= 13.2.0-9) [loong64]

  GCC Support-Bibliothek

  dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [amd64, x32]

  dep: libgcc-s1 (>= 3.4) [alpha]

  dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]

  dep: libgcc-s1 (>= 4.2) [ia64, ppc64el, sh4]

  dep: libgcc-s1 (>= 4.5) [arm64, mips64el, riscv64]

  dep: libgcc-s1 (>= 7) [i386]

• dep: libgcc-s2 (>= 4.2.1) [m68k]

  GCC Support-Bibliothek

• dep: libgcc-s4 (>= 4.1.1) [hppa]

  GCC Support-Bibliothek

• dep: libhts3 (>= 1.10) [hppa]

  C-Bibliothek für Hochdurchsatz-Sequenzierungsdatenformate

• dep: libhts3t64 (>= 1.17) [nicht hppa]

  C-Bibliothek für Hochdurchsatz-Sequenzierungsdatenformate

• dep: libjs-jquery

  JavaScript-Bibliothek für dynamische Webanwendungen

• dep: libjs-jquery-datatables

  jQuery-Plug-in, das aus verschiedenen Datenquellen schöne Tabellen erstellt

• dep: libjs-jquery-datatables-extensions

  extensions for the jQuery plug-in for tables from different data sources

• dep: libncurses6 (>= 6)

  Laufzeitbibliotheken zur Terminalsteuerung

• dep: libstdc++6 (>= 11) [hppa]

  GNU-Implementierung der Standard-C++-Bibliothek (Version 3)

  dep: libstdc++6 (>= 13.1) [nicht alpha, arm64, armhf, hppa, i386, riscv64, x32]

  dep: libstdc++6 (>= 14) [arm64, armhf, i386, riscv64, x32]

  dep: libstdc++6 (>= 14-20240127-1) [alpha]

• dep: libunwind8 [ia64]

  Bibliothek zur Ermittlung der Aufrufkette eines Programms - Laufzeit

• dep: node-d3

  Data-Driven Documents to visualize data

• dep: node-normalize.css

  Moderne Alternative zum Rücksetzen von Cascading Style Sheets

• dep: python3

  interactive high-level object-oriented language (default python3 version)

• sug: macs

  Model-based Analysis of ChIP-Seq on short reads sequencers

• sug: picard-tools

  Command line tools to manipulate SAM and BAM files

• sug: samtools

  processing sequence alignments in SAM, BAM and CRAM formats

• sug: wget

  Lädt Dateien aus dem Web

ataqv herunterladen

Download für alle verfügbaren Architekturen

Architektur	Version	Paketgröße	Größe (installiert)	Dateien
alpha (inoffizielle Portierung)	1.3.1+ds-2+b3	3.279,1 kB	6.729,0 kB	[Liste der Dateien]
amd64	1.3.1+ds-2+b2	3.320,5 kB	6.526,0 kB	[Liste der Dateien]
arm64	1.3.1+ds-2+b4	3.258,0 kB	6.465,0 kB	[Liste der Dateien]
armel	1.3.1+ds-2+b2	3.238,7 kB	6.232,0 kB	[Liste der Dateien]
armhf	1.3.1+ds-2+b3	3.248,1 kB	5.887,0 kB	[Liste der Dateien]
hppa (inoffizielle Portierung)	1.3.0+ds-1	3.327,2 kB	6.725,0 kB	[Liste der Dateien]
i386	1.3.1+ds-2+b3	3.355,6 kB	6.631,0 kB	[Liste der Dateien]
ia64 (inoffizielle Portierung)	1.3.1+ds-2+b2	3.358,7 kB	8.035,0 kB	[Liste der Dateien]
loong64 (inoffizielle Portierung)	1.3.1+ds-2+b2	3.260,3 kB	6.393,0 kB	[Liste der Dateien]
m68k (inoffizielle Portierung)	1.3.1+ds-2+b3	3.304,0 kB	6.487,0 kB	[Liste der Dateien]
mips64el	1.3.1+ds-2+b2	3.249,9 kB	6.868,0 kB	[Liste der Dateien]
ppc64el	1.3.1+ds-2+b2	3.296,8 kB	6.723,0 kB	[Liste der Dateien]
riscv64	1.3.1+ds-2+b3	3.308,5 kB	6.178,0 kB	[Liste der Dateien]
sh4 (inoffizielle Portierung)	1.3.1+ds-2+b3	3.377,5 kB	6.467,0 kB	[Liste der Dateien]
x32 (inoffizielle Portierung)	1.3.1+ds-2+b3	3.327,9 kB	6.416,0 kB	[Liste der Dateien]