Paket: ataqv (1.2.1+ds-1 und andere)

[ Quellcode: ataqv  ]

ATAC-seq QC and visualization

A toolkit for measuring and comparing ATAC-seq results, made in the Parker lab at the University of Michigan. They wrote it to help understand how well their ATAC-seq assays had worked, and to make it easier to spot differences that might be caused by library prep or sequencing.

Markierungen: GUI-Baukasten: Ncurses TUI

Andere Pakete mit Bezug zu ataqv

• dep: fonts-font-awesome

  Symbol-Schriftart für die Verwendung mit Twitter Bootstrap

• dep: libboost-chrono1.74.0 (>= 1.74.0)

  C++-Darstellung von Zeitspannen, Zeitpunkten und Uhren

• dep: libboost-filesystem1.74.0 (>= 1.74.0)

  Dateisystemoperationen (portable Pfade, Iterationen über Verzeichnisse, usw.) in C++

• dep: libboost-iostreams1.74.0 (>= 1.74.0)

  Boost.Iostreams-Bibliothek

• dep: libc6 (>= 2.14) [amd64]

  GNU-C-Bibliothek: Laufzeitbibliotheken
  auch ein virtuelles Paket, bereitgestellt durch libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.17) [arm64]

  dep: libc6 (>= 2.22) [ppc64el]

  dep: libc6 (>= 2.4) [nicht amd64, arm64, ppc64el]

• dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [amd64]

  GCC Support-Bibliothek

  dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armhf]

  dep: libgcc-s1 (>= 4.2) [i386, mipsel, ppc64el]

  dep: libgcc-s1 (>= 4.5) [arm64, mips64el]

• dep: libhts3 (>= 1.10)

  C-Bibliothek für Hochdurchsatz-Sequenzierungsdatenformate

• dep: libjs-jquery

  JavaScript-Bibliothek für dynamische Webanwendungen

• dep: libjs-jquery-datatables

  jQuery-Plug-in, das aus verschiedenen Datenquellen schöne Tabellen erstellt

• dep: libjs-jquery-datatables-extensions

  extensions for the jQuery plug-in for tables from different data sources

• dep: libncurses6 (>= 6)

  Laufzeitbibliotheken zur Terminalsteuerung

• dep: libstdc++6 (>= 9)

  GNU-Implementierung der Standard-C++-Bibliothek (Version 3)

• dep: node-d3

  Data-Driven Documents to visualize data

• dep: node-normalize.css

  Moderne Alternative zum Rücksetzen von Cascading Style Sheets

• dep: python3

  Interaktive objektorientierte Hochsprache (Python3-Standardversion)

• sug: macs

  Model-based Analysis of ChIP-Seq on short reads sequencers

• sug: picard-tools

  Kommandozeilenwerkzeuge zur Bearbeitung von SAM- und BAM-Dateien

• sug: samtools

  processing sequence alignments in SAM, BAM and CRAM formats

• sug: wget

  Lädt Dateien aus dem Web

ataqv herunterladen

Download für alle verfügbaren Architekturen

Architektur	Version	Paketgröße	Größe (installiert)	Dateien
amd64	1.2.1+ds-1+b1	3.316,6 kB	6.500,0 kB	[Liste der Dateien]
arm64	1.2.1+ds-1+b1	3.265,7 kB	6.364,0 kB	[Liste der Dateien]
armhf	1.2.1+ds-1+b1	3.254,5 kB	5.850,0 kB	[Liste der Dateien]
i386	1.2.1+ds-1+b1	3.351,7 kB	6.622,0 kB	[Liste der Dateien]
mips64el	1.2.1+ds-1+b1	3.258,6 kB	6.904,0 kB	[Liste der Dateien]
mipsel	1.2.1+ds-1+b1	3.272,6 kB	6.867,0 kB	[Liste der Dateien]
ppc64el	1.2.1+ds-1+b1	3.305,9 kB	6.848,0 kB	[Liste der Dateien]