Package: yanosim (0.1-6 and others)

[ Source: yanosim  ]

Læs simulator nanopore DRS-datasæt

Yanosim har tre indstillinger:

1. Yanosim model:

   Opretter en model af forskelle, indsættelser og sletninger
   baseret på en sammenligning af nanopore DRS-læsninger til en
   reference. Læsninger bør sammenlignes med et transkriptom
   d.v.s. uden opdelt sammenligning, via minimap2. De bør have
   mærket cs

2. Yanosim quantify:

   Kvantificer antallet af læsninger oversat til hvert
   transkript i en reference, så det rigtige antal læsninger
   kan simuleres

3. Yanosim simulate:

   Givet en model oprettet via yanosim model og per transkript-
   læste antal oprettet via yanosim simulate, simulerer fejlramte
   lange-læsninger fra den givne fasta-fil

Other Packages Related to yanosim

• dep: python3

  Interaktivt objektorienteret højniveausprog - standardversion af Python 3

• dep: python3-click

  Oprettelsessæt for kommandolinjegrænsefladen - Python 3.x

• dep: python3-numpy

  Pythonbibliotek til numeriske beregninger - Python 3

• dep: python3-pysam

  Grænseflade for SAM/BAM-sekvenssammenligning og oversættelsesformatet - Python 3

• dep: python3-scipy

  Videnskabelige værktøjer for Python 3

Download yanosim

Download for all available architectures

Architecture	Version	Package Size	Installed Size	Files
alpha (unofficial port)	0.1-6	9.5 kB	45.0 kB	[list of files]
amd64	0.1-6	9.5 kB	45.0 kB	[list of files]
arm64	0.1-6	9.5 kB	45.0 kB	[list of files]
armel	0.1-6	9.5 kB	45.0 kB	[list of files]
armhf	0.1-6	9.5 kB	45.0 kB	[list of files]
hppa (unofficial port)	0.1-2	9.1 kB	45.0 kB	[list of files]
i386	0.1-6	9.5 kB	45.0 kB	[list of files]
ia64 (unofficial port)	0.1-5	9.4 kB	45.0 kB	[list of files]
m68k (unofficial port)	0.1-6	9.5 kB	45.0 kB	[list of files]
mips64el	0.1-6	9.5 kB	45.0 kB	[list of files]
ppc64 (unofficial port)	0.1-2	9.1 kB	45.0 kB	[list of files]
ppc64el	0.1-6	9.5 kB	45.0 kB	[list of files]
riscv64	0.1-6	9.5 kB	45.0 kB	[list of files]
sh4 (unofficial port)	0.1-6	9.5 kB	45.0 kB	[list of files]
sparc64 (unofficial port)	0.1-2	9.1 kB	45.0 kB	[list of files]
x32 (unofficial port)	0.1-6	9.5 kB	45.0 kB	[list of files]