Package: gsort (0.1.4-3 and others) [debports]

[ Source:  ]

Sorter genomiske data

Gsort er et værktøj til at sortere genomiske filer jævnfør en genomfil. For eksempel, for at sortere VCF til rækkefølgeordning: X, Y, 2, 1, 3, ... og teksthovedet skal være øverst.

Et mere sandsynligt eksempel, hvis en fil skal sorteres for at matche GATK-rækkefølgen (1 ... X, Y, MT), hvilket ikke er muligt med noget sorteringsværktøj. Med gsort kan man bare placere MT som det sidste kromosom i ».genome«-filen.

Vil også være nyttig for at hente filer klar til brug i bedtools.

Other Packages Related to gsort

• dep: libc6 (>= 2.34)

  GNU C-bibliotek: Delte biblioteker
  also a virtual package provided by libc6-udeb

• dep: libgcc-s1 (>= 3.3.1)

  GCC støttebibliotek

• dep: libgo22

  Kørselstidsbibliotek for GNU Go-programmer

Download gsort

Download for all available architectures

Architecture	Version	Package Size	Installed Size	Files
x32 (unofficial port)	0.1.4-3+b10	175.1 kB	703.0 kB	[list of files]