Пакет: gsort (0.1.4-3 и други) [debports]

[ Източник:  ]

sort genomic data

gsort is a tool to sort genomic files according to a genomefile. For example, to sort VCF to have order: X, Y, 2, 1, 3, ... and the header needs to be kept at the top.

As a more likely example, if a file nneds to be sorted to match GATK order (1 ... X, Y, MT) which is not possible with any other sorting tool. With gsort one can simply place MT as the last chrom in the ".genome" file.

It will also be useful for getting files ready for use in bedtools.

Други пакети, свързани с gsort

• dep: libc6 (>= 2.34)

  GNU C Library: Shared libraries
  също и виртуален пакет, предлаган от libc6-udeb

• dep: libgcc-s1 (>= 3.3.1)

  GCC support library

• dep: libgo22

  Runtime library for GNU Go applications

Изтегляне на gsort

Изтегляне за всички налични архитектури

Архитектура	Версия	Големина на пакета	Големина след инсталиране	Файлове
x32 (неофициална архитектура)	0.1.4-3+b10	175,1 кБ	703,0 кБ	[списък на файловете]