Paket: gsort (0.1.4-3 och andra) [debports]

[ Källkod:  ]

sort genomic data

gsort is a tool to sort genomic files according to a genomefile. For example, to sort VCF to have order: X, Y, 2, 1, 3, ... and the header needs to be kept at the top.

As a more likely example, if a file nneds to be sorted to match GATK order (1 ... X, Y, MT) which is not possible with any other sorting tool. With gsort one can simply place MT as the last chrom in the ".genome" file.

It will also be useful for getting files ready for use in bedtools.

Andra paket besläktade med gsort

• dep: libc6 (>= 2.34)

  GNU C-bibliotek: Delade bibliotek
  också ett virtuellt paket som tillhandahålls av libc6-udeb

• dep: libgcc-s1 (>= 3.3.1)

  GCC stödbibliotek

• dep: libgo22

  Runtime library for GNU Go applications

Hämta gsort

Hämtningar för alla tillgängliga arkitekturer

Arkitektur	Version	Paketstorlek	Installerad storlek	Filer
x32 (inofficiell anpassning)	0.1.4-3+b10	175,1 kbyte	703,0 kbyte	[filförteckning]