Package: hinge (0.5.0-2) [debports]

[ Source:  ]

Assembler til læsning af lange genomer baseret på hinging

HINGE er en genomassembler, som forsøger at opnå optimal gentagelsesopslag ved at skelne gentagelser, som kan slås op givet dataene fra disse som ikke kan. Dette opnås ved at tilføje »hinges« til læsninger for at konstruere en graf med overlap hvor kun gentagelser, der ikke kunne slås op, sammenføjes. Som resultat kombinerer HINGE fejltolerancen for overlap-baserede assemblere med gentag-opslags funktioner for de Bruijn-grafassemblere.

Other Packages Related to hinge

• dep: daligner

  Lokal tilpasningsregistrering mellem lange nukleotidsekventeringslæsninger

• dep: dascrubber

  Sammenligningsbaseret scrubbing-datakanal for DNA-sekvenslæsninger

• dep: dazzdb

  Håndter data for nukleotidsekventeringslæsning

• dep: libc6 (>= 2.7)

  GNU C-bibliotek: Delte biblioteker
  also a virtual package provided by libc6-udeb

• dep: libgcc1 (>= 1:3.4)

  Package not available

• dep: libgomp1 (>= 4.2.1)

  GCC OpenMP-understøttelsesbibliotek (GOMP)

• dep: libstdc++6 (>= 5.2)

  GNU Standard C++ bibliotek v3

• dep: python

  Package not available

• dep: python-colormap

  Package not available

• dep: python-configparser

  Package not available

• dep: python-matplotlib

  Package not available

• dep: python-networkx

  Package not available

• dep: python-numpy

  Package not available

• dep: python-pbcore

  virtual package provided by python3-pbcore

• dep: python-ujson

  Package not available

• dep: zlib1g (>= 1:1.1.4)

  Komprimeringsbibliotek - kørselstid

Download hinge

Download for all available architectures

Architecture	Package Size	Installed Size	Files
sparc64 (unofficial port)	328.1 kB	2,445.0 kB	[list of files]