Пакет: hinge (0.5.0-2) [debports]

[ Източник:  ]

long read genome assembler based on hinging

HINGE is a genome assembler that seeks to achieve optimal repeat resolution by distinguishing repeats that can be resolved given the data from those that cannot. This is accomplished by adding “hinges” to reads for constructing an overlap graph where only unresolvable repeats are merged. As a result, HINGE combines the error resilience of overlap-based assemblers with repeat-resolution capabilities of de Bruijn graph assemblers.

Други пакети, свързани с hinge

• dep: daligner

  local alignment discovery between long nucleotide sequencing reads

• dep: dascrubber

  alignment-based scrubbing pipeline for DNA sequencing reads

• dep: dazzdb

  manage nucleotide sequencing read data

• dep: libc6 (>= 2.7)

  GNU C Library: Shared libraries
  също и виртуален пакет, предлаган от libc6-udeb

• dep: libgcc1 (>= 1:3.4)

  Пакетът не е наличен

• dep: libgomp1 (>= 4.2.1)

  GCC OpenMP (GOMP) support library

• dep: libstdc++6 (>= 5.2)

  GNU Standard C++ Library v3

• dep: python

  Пакетът не е наличен

• dep: python-colormap

  Пакетът не е наличен

• dep: python-configparser

  Пакетът не е наличен

• dep: python-matplotlib

  Пакетът не е наличен

• dep: python-networkx

  Пакетът не е наличен

• dep: python-numpy

  Пакетът не е наличен

• dep: python-pbcore

  виртуален пакет, предлаган от python3-pbcore

• dep: python-ujson

  Пакетът не е наличен

• dep: zlib1g (>= 1:1.1.4)

  compression library - runtime

Изтегляне на hinge

Изтегляне за всички налични архитектури

Архитектура	Големина на пакета	Големина след инсталиране	Файлове
sparc64 (неофициална архитектура)	328,1 кБ	2 445,0 кБ	[списък на файловете]