パッケージ: hinge (0.5.0-2) [debports]
long read genome assembler based on hinging
HINGE is a genome assembler that seeks to achieve optimal repeat resolution by distinguishing repeats that can be resolved given the data from those that cannot. This is accomplished by adding “hinges” to reads for constructing an overlap graph where only unresolvable repeats are merged. As a result, HINGE combines the error resilience of overlap-based assemblers with repeat-resolution capabilities of de Bruijn graph assemblers.
その他の hinge 関連パッケージ
|
|
|
|
-
- dep: daligner
- ロングリードヌクレオチド配列間のローカルアラインメント発見
-
- dep: dascrubber
- alignment-based scrubbing pipeline for DNA sequencing reads
-
- dep: dazzdb
- manage nucleotide sequencing read data
-
- dep: libc6 (>= 2.7)
- GNU C ライブラリ: 共有ライブラリ
以下のパッケージによって提供される仮想パッケージでもあります: libc6-udeb
-
- dep: libgcc1 (>= 1:3.4)
- パッケージは利用できません
-
- dep: libgomp1 (>= 4.2.1)
- GCC OpenMP (GOMP) サポートライブラリ
-
- dep: libstdc++6 (>= 5.2)
- GNU 標準 C++ ライブラリ v3
-
- dep: python
- パッケージは利用できません
-
- dep: python-colormap
- パッケージは利用できません
-
- dep: python-configparser
- パッケージは利用できません
-
- dep: python-matplotlib
- パッケージは利用できません
-
- dep: python-networkx
- パッケージは利用できません
-
- dep: python-numpy
- パッケージは利用できません
-
- dep: python-pbcore
- 以下のパッケージによって提供される仮想パッケージです: python3-pbcore
-
- dep: python-ujson
- パッケージは利用できません
-
- dep: zlib1g (>= 1:1.1.4)
- 圧縮ライブラリ - ランタイム