Пакет: clustalw (2.1+lgpl-7 и други)

[ Източник: clustalw  ]

global multiple nucleotide or peptide sequence alignment

This program performs an alignment of multiple nucleotide or amino acid sequences. It recognizes the format of input sequences and whether the sequences are nucleic acid (DNA/RNA) or amino acid (proteins). The output format may be selected from in various formats for multiple alignments such as Phylip or FASTA. Clustal W is very well accepted.

The output of Clustal W can be edited manually but preferably with an alignment editor like SeaView or within its companion Clustal X. When building a model from your alignment, this can be applied for improved database searches. The Debian package hmmer creates such in form of an HMM.

Етикети: Biology: Clustal/ALN, Proteins, Field: field::biology, field::biology:bioinformatics, Implemented in: implemented-in::c++, interface::commandline, User Interface: Text-based Interactive, Role: role::program, scope::utility, Purpose: Comparing, Supports Format: works-with-format::plaintext, works-with::TODO

Други пакети, свързани с clustalw

• dep: libc6 (>= 2.29) [не alpha, arm64, ia64, riscv64, sh4]

  GNU C Library: Shared libraries
  също и виртуален пакет, предлаган от libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.31) [sh4]

  dep: libc6 (>= 2.34) [riscv64]

  dep: libc6 (>= 2.38) [arm64]

• dep: libc6.1 (>= 2.29) [alpha]

  GNU C Library: Shared libraries
  също и виртуален пакет, предлаган от libc6.1-udeb

  dep: libc6.1 (>= 2.31) [ia64]

• dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [amd64, arm64, mips64el, ppc64, ppc64el, s390x, x32]

  GCC support library

  dep: libgcc-s1 (>= 3.4) [alpha, riscv64, sh4, sparc64]

  dep: libgcc-s1 (>= 4.2) [ia64]

• dep: libgcc-s2 (>= 4.2.1) [m68k]

  GCC support library

• dep: libgcc-s4 (>= 4.1.1) [hppa]

  GCC support library

• dep: libstdc++6 (>= 13.1) [riscv64]

  GNU Standard C++ Library v3

  dep: libstdc++6 (>= 14) [arm64]

  dep: libstdc++6 (>= 5.2) [не arm64, riscv64]

• dep: libunwind8 [ia64]

  library to determine the call-chain of a program - runtime

• sug: clustalx

  Multiple alignment of nucleic acid and protein sequences (graphical interface)

• sug: seaview

  Multiplatform interface for sequence alignment and phylogeny

• enh: bioperl-run

  BioPerl wrappers: scripts

• enh: emboss

  European molecular biology open software suite

• enh: t-coffee

  Multiple Sequence Alignment

Изтегляне на clustalw

Изтегляне за всички налични архитектури

Архитектура	Версия	Големина на пакета	Големина след инсталиране	Файлове
alpha (неофициална архитектура)	2.1+lgpl-7	276,6 кБ	920,0 кБ	[списък на файловете]
amd64	2.1+lgpl-7	275,1 кБ	787,0 кБ	[списък на файловете]
arm64	2.1+lgpl-7+b1	248,9 кБ	786,0 кБ	[списък на файловете]
hppa (неофициална архитектура)	2.1+lgpl-7	259,6 кБ	737,0 кБ	[списък на файловете]
ia64 (неофициална архитектура)	2.1+lgpl-7	344,9 кБ	1 516,0 кБ	[списък на файловете]
m68k (неофициална архитектура)	2.1+lgpl-7	264,7 кБ	790,0 кБ	[списък на файловете]
mips64el	2.1+lgpl-7	259,1 кБ	941,0 кБ	[списък на файловете]
ppc64 (неофициална архитектура)	2.1+lgpl-7	276,1 кБ	982,0 кБ	[списък на файловете]
ppc64el	2.1+lgpl-7	276,5 кБ	918,0 кБ	[списък на файловете]
riscv64	2.1+lgpl-7+b1	274,2 кБ	622,0 кБ	[списък на файловете]
s390x	2.1+lgpl-7	247,5 кБ	794,0 кБ	[списък на файловете]
sh4 (неофициална архитектура)	2.1+lgpl-7	314,8 кБ	714,0 кБ	[списък на файловете]
sparc64 (неофициална архитектура)	2.1+lgpl-7	231,2 кБ	747,0 кБ	[списък на файловете]
x32 (неофициална архитектура)	2.1+lgpl-7	275,3 кБ	750,0 кБ	[списък на файловете]