Package: cnvkit (0.9.10-3~0exp0)

[ Source: cnvkit  ]

Experimental package

Warning: This package is from the experimental distribution. That means it is likely unstable or buggy, and it may even cause data loss. Please be sure to consult the changelog and other possible documentation before using it.

Kopier nummervariantregistrering fra målrettet DNA-sekventering

Et værktøjssæt for kommandolinjen og Pythonbibliotek til at registrere kopinummervarianter og ændringer på tværs af genomet fra målrettet DNA- sekventering. Er designet for brug med hybrid optagelse, inklusive både whole-exome og tilpassede målpaneler, og kort-læs sekventeringsplatforme såsom Illumina og Ion Torrent.

Other Packages Related to cnvkit

• dep: python3

  interactive high-level object-oriented language (default python3 version)

• dep: python3-biopython

  Python 3-bibliotek for bioinformatik

• dep: python3-matplotlib

  Pythonbaseret plotsystem i en stil der ligner Matlab

• dep: python3-numpy

  Python library for numerical computations (Python 3)

• dep: python3-pandas

  Datastrukturer for »relationelle« data eller »etiketdata«

• dep: python3-pomegranate

  Fast, flexible and easy to use probabilistic modelling

• dep: python3-pyfaidx

  Effektiv vilkårlig adgang til fasta-undersekvenser for Python 3

• dep: python3-pysam

  Grænseflade for SAM/BAM-sekvenssammenligning og oversættelsesformatet - Python 3

• dep: python3-reportlab

  ReportLab-bibliotek til at oprette PDF-dokumenter der bruger Python 3

• dep: python3-scipy

  Videnskabelige værktøjer for Python 3

• dep: python3-sklearn

  Pythonmoduler for maskinlæring og dataundersøgelse - Python 3

• dep: r-bioc-dnacopy (>= 1.78.0)

  R-pakke: dataanalyse af DNA-kopinummer

Download cnvkit

Download for all available architectures

Architecture	Package Size	Installed Size	Files
all	19,048.0 kB	94,731.0 kB	[list of files]