Package: r-bioc-dnacopy (1.80.0-1)

[ Source: r-bioc-dnacopy  ]

Experimental package

Warning: This package is from the experimental distribution. That means it is likely unstable or buggy, and it may even cause data loss. Please be sure to consult the changelog and other possible documentation before using it.

R-pakke: dataanalyse af DNA-kopinummer

Denne pakke implementerer den cirkulære binære segmenteringsalgoritme (CBS) til at segmentere DNA-kopinummerdata og identificere genomiske regioner med unormal kopinummer.

Denne pakke er lavet til at analysere tabel-DNA-kopinummerdata, der normalt (men ikke altid) kaldes array Comparative Genomic Hybridization-data (array CGH). Pakken implementerer en metode til at finde change-points i disse data, der er punkter hvorefter testen (log) over referenceforhold har ændret placering. Denne model er at change-points korresponderer til positioner hvor det underliggende DNA-kopinummer har ændret sig. Derfor kan change-points bruges til at identificere regioner med opnåede og mistede kopinummer. Der tilbydes også en funktion til at lave relevante plot for disse data.

Other Packages Related to r-bioc-dnacopy

• dep: libc6 (>= 2.27) [riscv64]

  GNU C-bibliotek: Delte biblioteker
  also a virtual package provided by libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.29) [not riscv64]

• dep: libgfortran5 (>= 10)

  Kørselstidsbibliotek for GNU Fortran-programmer

• dep: r-api-4.0

  Package not available

• dep: r-api-bioc-3.20

  virtual package provided by r-bioc-biocgenerics

Download r-bioc-dnacopy

Download for all available architectures

Architecture	Package Size	Installed Size	Files
amd64	486.7 kB	609.0 kB	[list of files]
arm64	484.7 kB	621.0 kB	[list of files]
mips64el	485.6 kB	622.0 kB	[list of files]
ppc64 (unofficial port)	489.8 kB	622.0 kB	[list of files]
ppc64el	488.6 kB	621.0 kB	[list of files]
riscv64	486.8 kB	593.0 kB	[list of files]
s390x	489.1 kB	605.0 kB	[list of files]
sparc64 (unofficial port)	483.9 kB	1,582.0 kB	[list of files]