Package: arden (1.0-4)

[ Source: arden  ]

Specificitetskontrol for læse sammenligninger ved anvendelse af en kunstig reference

ARDEN (Artificial Reference Driven Estimation of false positives in NGS data) er en begyndende sammenligning (benchmark), der estimerer fejlprocenter baseret på virkelige eksperimentelle læsninger og en yderligere genereret kunstig referencearvemasse. Det giver mulighed for beregning af fejlprocenter specifikke for et datasæt og konstruktion af en ROC-kurve. Derved kan det bruges til at optimere parametre for læste kortlæggere, til at vælge læsningsoversættere for et specifikt problem eller også til at filtrere sammenligninger baseret på kvalitetsskøn.

Other Packages Related to arden

• dep: python

  Interaktivt objektorienteret sprog på højt niveau - Python 2-version

• dep: python-htseq

  Python high-throughput genome sequencing read analysis utilities
  also a virtual package provided by python3-htseq

• dep: python-matplotlib

  Pythonbaseret plotsystem i en stil der ligner Matlab

• dep: python-numpy

  Numerisk Python tilføjer en hurtig vektor-/array-facilitet til Pythonsproget

• dep: python-scipy

  Videnskabelige værktøjer for Python

Download arden

Download for all available architectures

Architecture	Package Size	Installed Size	Files
all	86.7 kB	1,155.0 kB	[list of files]