Package: nanopolish (0.11.0-2)

[ Source: nanopolish  ]

Konsensuskalder for nanopore-sekvensdata

Nanoplish bruger en skjult Markovmodel på signalniveau til konsensuskald af nanospores genomsekvensdata. Programmet kan udføre analyse på signalniveau for Oxford Nanopore-sekvensdata. Nanopolish kan beregne en forbedret konsensussekvens for en kladdegenomsamling, registrere baseændringer, kalde SNP'er og indels med respekt for et referencegenom med mere.

Other Packages Related to nanopolish

• dep: libc6 (>= 2.27)

  GNU C-bibliotek: Delte biblioteker
  also a virtual package provided by libc6-udeb

• dep: libgcc1 (>= 1:3.3.1)

  GCC støttebibliotek

• dep: libgomp1 (>= 4.9)

  GCC OpenMP-understøttelsesbibliotek (GOMP)

• dep: libhdf5-103

  Hierarchical Data Format 5 (HDF5) - kørselstidsfiler - seriel version

• dep: libhts2 (>= 1.4.1)

  C-bibliotek for høj-gennemløb sekvensdataformater

• dep: libstdc++6 (>= 5.2)

  GNU Standard C++ bibliotek v3

• dep: python

  Interaktivt objektorienteret sprog på højt niveau - Python 2-version

• dep: zlib1g (>= 1:1.1.4)

  Komprimeringsbibliotek - kørselstid

• rec: python-biopython

  Pythonbibliotek for bioinformatikere - implementeret i Python 2

• rec: python-pysam

  Grænseflade for SAM/BAM-sekvensopstilling og oversættelsesformat - Python 2

• sug: make

  Redskab til at dirigere kompileringen

• sug: perl

  Larry Walls praktiske uddragnings- og rapportsprog (Perl)

Download nanopolish

Download for all available architectures

Architecture	Package Size	Installed Size	Files
amd64	2,162.9 kB	9,781.0 kB	[list of files]