Paquet : libfastahack0 (1.0.0+dfsg-7)

[ Paquet source : libfastahack  ]

library for indexing and sequence extraction from FASTA files (lib)

fastahack is a small application for indexing and extracting sequences and subsequences from FASTA files. The included Fasta.cpp library provides a FASTA reader and indexer that can be embedded into applications which would benefit from directly reading subsequences from FASTA files. The library automatically handles index file generation and use.

Features:

 * FASTA index (.fai) generation for FASTA files
 * Sequence extraction
 * Subsequence extraction
 * Sequence statistics (currently only entropy is provided)

Sequence and subsequence extraction use fseek64 to provide fastest-possible extraction without RAM-intensive file loading operations. This makes fastahack a useful tool for bioinformaticists who need to quickly extract many subsequences from a reference FASTA sequence.

This package contains the dynamic library.

Étiquettes: Rôle: Bibliothèque partagée

Autres paquets associés à libfastahack0

• dep: libc6 (>= 2.14) [amd64]

  bibliothèque C GNU : bibliothèques partagées
  un paquet virtuel est également fourni par libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.17) [arm64, ppc64el]

  dep: libc6 (>= 2.4) [non amd64, arm64, ppc64el]

• dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [non armel, armhf]

  bibliothèque de prise en charge de GCC

  dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]

• dep: libstdc++6 (>= 5.2)

  bibliothèque standard C++ de GNU v3

Télécharger libfastahack0

Télécharger pour toutes les architectures proposées

Architecture	Taille du paquet	Espace occupé une fois installé	Fichiers
amd64	25,0 ko	83,0 ko	[liste des fichiers]
arm64	23,1 ko	75,0 ko	[liste des fichiers]
armel	23,3 ko	69,0 ko	[liste des fichiers]
armhf	23,7 ko	57,0 ko	[liste des fichiers]
i386	27,4 ko	81,0 ko	[liste des fichiers]
mips64el	24,3 ko	82,0 ko	[liste des fichiers]
mipsel	25,0 ko	79,0 ko	[liste des fichiers]
ppc64el	26,3 ko	87,0 ko	[liste des fichiers]
s390x	22,8 ko	77,0 ko	[liste des fichiers]