Пакет: phast (1.7+dfsg-2 и други)

[ Източник: phast  ]

phylogenetic analysis with space/time models

PHAST is a software package for comparative and evolutionary genomics. It consists of about half a dozen major programs, plus more than a dozen utilities for manipulating sequence alignments, phylogenetic trees, and genomic annotations. For the most part, PHAST focuses on two kinds of applications: the identification of novel functional elements, including protein-coding exons and evolutionarily conserved sequences; and statistical phylogenetic modeling, including estimation of model parameters, detection of signatures of selection, and reconstruction of ancestral sequences.

PHAST does not support phylogeny reconstruction or sequence alignment, and it is designed for use with DNA sequences only (see Comparison).

Други пакети, свързани с phast

• dep: libc6 (>= 2.34) [не alpha, ia64, loong64, sh4]

  GNU C Library: Shared libraries
  също и виртуален пакет, предлаган от libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.40) [loong64, sh4]

• dep: libc6.1 (>= 2.34) [alpha]

  GNU C Library: Shared libraries
  също и виртуален пакет, предлаган от libc6.1-udeb

  dep: libc6.1 (>= 2.37) [ia64]

• dep: liblapack3

  Library of linear algebra routines 3 - shared version

  или liblapack.so.3

  виртуален пакет, предлаган от libatlas3-base, liblapack3, libopenblas0-openmp, libopenblas0-pthread, libopenblas0-serial

• dep: libpcre2-8-0 (>= 10.22)

  New Perl Compatible Regular Expression Library- 8 bit runtime files

Изтегляне на phast

Изтегляне за всички налични архитектури

Архитектура	Версия	Големина на пакета	Големина след инсталиране	Файлове
alpha (неофициална архитектура)	1.7+dfsg-2	3 375,1 кБ	34 461,0 кБ	[списък на файловете]
amd64	1.7+dfsg-2	3 479,3 кБ	30 514,0 кБ	[списък на файловете]
arm64	1.7+dfsg-2	3 276,0 кБ	30 109,0 кБ	[списък на файловете]
armel	1.7+dfsg-2	2 820,9 кБ	28 598,0 кБ	[списък на файловете]
armhf	1.7+dfsg-2	2 704,9 кБ	21 430,0 кБ	[списък на файловете]
hppa (неофициална архитектура)	1.7+dfsg-2	3 021,3 кБ	29 528,0 кБ	[списък на файловете]
i386	1.7+dfsg-2	3 548,9 кБ	32 364,0 кБ	[списък на файловете]
ia64 (неофициална архитектура)	1.6+dfsg-5	3 541,5 кБ	55 315,0 кБ	[списък на файловете]
loong64 (неофициална архитектура)	1.7+dfsg-2	3 399,1 кБ	32 084,0 кБ	[списък на файловете]
m68k (неофициална архитектура)	1.7+dfsg-2	2 883,1 кБ	25 145,0 кБ	[списък на файловете]
mips64el	1.7+dfsg-2	3 387,4 кБ	34 638,0 кБ	[списък на файловете]
ppc64 (неофициална архитектура)	1.7+dfsg-2	3 489,3 кБ	39 006,0 кБ	[списък на файловете]
ppc64el	1.7+dfsg-2	3 495,7 кБ	37 406,0 кБ	[списък на файловете]
riscv64	1.7+dfsg-2	3 243,6 кБ	24 114,0 кБ	[списък на файловете]
s390x	1.7+dfsg-2	3 349,4 кБ	33 496,0 кБ	[списък на файловете]
sh4 (неофициална архитектура)	1.7+dfsg-2	2 779,9 кБ	25 405,0 кБ	[списък на файловете]
sparc64 (неофициална архитектура)	1.7+dfsg-2	3 024,1 кБ	46 006,0 кБ	[списък на файловете]
x32 (неофициална архитектура)	1.7+dfsg-2	3 465,1 кБ	30 285,0 кБ	[списък на файловете]