Paquet : phast (1.7+dfsg-2 et autres)

[ Paquet source : phast  ]

phylogenetic analysis with space/time models

PHAST is a software package for comparative and evolutionary genomics. It consists of about half a dozen major programs, plus more than a dozen utilities for manipulating sequence alignments, phylogenetic trees, and genomic annotations. For the most part, PHAST focuses on two kinds of applications: the identification of novel functional elements, including protein-coding exons and evolutionarily conserved sequences; and statistical phylogenetic modeling, including estimation of model parameters, detection of signatures of selection, and reconstruction of ancestral sequences.

PHAST does not support phylogeny reconstruction or sequence alignment, and it is designed for use with DNA sequences only (see Comparison).

Autres paquets associés à phast

• dep: libc6 (>= 2.34) [non alpha, ia64, loong64, sh4]

  bibliothèque C GNU : bibliothèques partagées
  un paquet virtuel est également fourni par libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.40) [loong64, sh4]

• dep: libc6.1 (>= 2.34) [alpha]

  bibliothèque C GNU : bibliothèques partagées
  un paquet virtuel est également fourni par libc6.1-udeb

  dep: libc6.1 (>= 2.37) [ia64]

• dep: liblapack3

  bibliothèque de routines algébriques version⋅3 –⋅version partagée

  ou liblapack.so.3

  paquet virtuel fourni par libatlas3-base, liblapack3, libopenblas0-openmp, libopenblas0-pthread, libopenblas0-serial

• dep: libpcre2-8-0 (>= 10.22)

  nouvelle bibliothèque d'expressions rationnelles compatibles Perl –⋅fichiers d'exécution⋅8⋅bits

Télécharger phast

Télécharger pour toutes les architectures proposées

Architecture	Version	Taille du paquet	Espace occupé une fois installé	Fichiers
alpha (portage non officiel)	1.7+dfsg-2	3 375,1 ko	34 461,0 ko	[liste des fichiers]
amd64	1.7+dfsg-2	3 479,3 ko	30 514,0 ko	[liste des fichiers]
arm64	1.7+dfsg-2	3 276,0 ko	30 109,0 ko	[liste des fichiers]
armel	1.7+dfsg-2	2 820,9 ko	28 598,0 ko	[liste des fichiers]
armhf	1.7+dfsg-2	2 704,9 ko	21 430,0 ko	[liste des fichiers]
hppa (portage non officiel)	1.7+dfsg-2	3 021,3 ko	29 528,0 ko	[liste des fichiers]
i386	1.7+dfsg-2	3 548,9 ko	32 364,0 ko	[liste des fichiers]
ia64 (portage non officiel)	1.6+dfsg-5	3 541,5 ko	55 315,0 ko	[liste des fichiers]
loong64 (portage non officiel)	1.7+dfsg-2	3 399,1 ko	32 084,0 ko	[liste des fichiers]
m68k (portage non officiel)	1.7+dfsg-2	2 883,1 ko	25 145,0 ko	[liste des fichiers]
mips64el	1.7+dfsg-2	3 387,4 ko	34 638,0 ko	[liste des fichiers]
ppc64 (portage non officiel)	1.7+dfsg-2	3 489,3 ko	39 006,0 ko	[liste des fichiers]
ppc64el	1.7+dfsg-2	3 495,7 ko	37 406,0 ko	[liste des fichiers]
riscv64	1.7+dfsg-2	3 243,6 ko	24 114,0 ko	[liste des fichiers]
s390x	1.7+dfsg-2	3 349,4 ko	33 496,0 ko	[liste des fichiers]
sh4 (portage non officiel)	1.7+dfsg-2	2 779,9 ko	25 405,0 ko	[liste des fichiers]
sparc64 (portage non officiel)	1.7+dfsg-2	3 024,1 ko	46 006,0 ko	[liste des fichiers]
x32 (portage non officiel)	1.7+dfsg-2	3 465,1 ko	30 285,0 ko	[liste des fichiers]