套件：phast（1.6+dfsg-6 以及其他的）

[ 原始碼： phast  ]

phylogenetic analysis with space/time models

PHAST is a software package for comparative and evolutionary genomics. It consists of about half a dozen major programs, plus more than a dozen utilities for manipulating sequence alignments, phylogenetic trees, and genomic annotations. For the most part, PHAST focuses on two kinds of applications: the identification of novel functional elements, including protein-coding exons and evolutionarily conserved sequences; and statistical phylogenetic modeling, including estimation of model parameters, detection of signatures of selection, and reconstruction of ancestral sequences.

PHAST does not support phylogeny reconstruction or sequence alignment, and it is designed for use with DNA sequences only (see Comparison).

其他與 phast 有關的套件

• dep: libblas3 [sparc64]

  Basic Linear Algebra Reference implementations, shared library

  或者 libblas.so.3

  本虛擬套件由這些套件填實： libatlas3-base, libblas3, libblis4-openmp, libblis4-pthread, libblis4-serial, libopenblas0-openmp, libopenblas0-pthread, libopenblas0-serial

• dep: libc6 (>= 2.34) [除 alpha, ia64, sh4]

  GNU C 函式庫：共用函式庫
  同時作為一個虛擬套件由這些套件填實： libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.39) [sh4]

• dep: libc6.1 (>= 2.34) [alpha]

  GNU C 函式庫：共用函式庫
  同時作為一個虛擬套件由這些套件填實： libc6.1-udeb

  dep: libc6.1 (>= 2.37) [ia64]

• dep: liblapack3

  Library of linear algebra routines 3 - shared version

  或者 liblapack.so.3

  本虛擬套件由這些套件填實： libatlas3-base, liblapack3, libopenblas0-openmp, libopenblas0-pthread, libopenblas0-serial

• dep: libpcre2-8-0 (>= 10.22)

  New Perl Compatible Regular Expression Library- 8 bit runtime files

• dep: libtmglib3 (>= 3.12.0) [sparc64]

  test matrix generators of LAPACK - shared version

下載 phast

下載可用於所有硬體架構的

硬體架構	版本	套件大小	安裝後大小	檔案
alpha （非官方移植版）	1.6+dfsg-6	2，861。9 kB	28，907。0 kB	[檔案列表]
amd64	1.6+dfsg-6	2，971。1 kB	25，691。0 kB	[檔案列表]
arm64	1.6+dfsg-6	2，815。6 kB	25，262。0 kB	[檔案列表]
armel	1.6+dfsg-6	2，606。3 kB	23，241。0 kB	[檔案列表]
armhf	1.6+dfsg-6	2，504。3 kB	17，389。0 kB	[檔案列表]
hppa （非官方移植版）	1.6+dfsg-6	2，684。6 kB	24，904。0 kB	[檔案列表]
i386	1.6+dfsg-6	3，017。5 kB	27，259。0 kB	[檔案列表]
ia64 （非官方移植版）	1.6+dfsg-5	3，541。5 kB	55，315。0 kB	[檔案列表]
m68k （非官方移植版）	1.6+dfsg-6	2，644。1 kB	21，361。0 kB	[檔案列表]
mips64el	1.6+dfsg-6	2，856。8 kB	29，065。0 kB	[檔案列表]
ppc64 （非官方移植版）	1.6+dfsg-6	3，153。4 kB	32，686。0 kB	[檔案列表]
ppc64el	1.6+dfsg-6	3，174。3 kB	31，278。0 kB	[檔案列表]
riscv64	1.6+dfsg-6	2，951。9 kB	20，510。0 kB	[檔案列表]
s390x	1.6+dfsg-6	2，839。6 kB	28，115。0 kB	[檔案列表]
sh4 （非官方移植版）	1.6+dfsg-6	2，568。3 kB	21，587。0 kB	[檔案列表]
sparc64 （非官方移植版）	1.6+dfsg-6	2，803。5 kB	38，774。0 kB	[檔案列表]
x32 （非官方移植版）	1.6+dfsg-6	2，955。5 kB	25，541。0 kB	[檔案列表]