Пакет: hilive (2.0a-4 и други)

[ Източник: hilive  ]

realtime alignment of Illumina reads

HiLive is a read mapping tool that maps Illumina HiSeq (or comparable) reads to a reference genome right in the moment when they are produced. This means, read mapping is finished as soon as the sequencer is finished generating the data.

Други пакети, свързани с hilive

• dep: libboost-atomic1.83.0 (>= 1.83.0) [sparc64]

  atomic data types, operations, and memory ordering constraints

• dep: libboost-filesystem1.83.0 (>= 1.83.0)

  filesystem operations (portable paths, iteration over directories, etc) in C++

• dep: libboost-iostreams1.83.0 (>= 1.83.0) [sparc64]

  Boost.Iostreams Library

• dep: libboost-program-options1.83.0 (>= 1.83.0)

  program options library for C++

• dep: libboost-system1.83.0 (>= 1.83.0) [sparc64]

  Operating system (e.g. diagnostics support) library

• dep: libc6 (>= 2.37) [sh4]

  GNU C Library: Shared libraries
  също и виртуален пакет, предлаган от libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.38) [не alpha, ia64, sh4]

• dep: libc6.1 (>= 2.34) [alpha]

  GNU C Library: Shared libraries
  също и виртуален пакет, предлаган от libc6.1-udeb

  dep: libc6.1 (>= 2.37) [ia64]

• dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [arm64, ppc64el, s390x]

  GCC support library

  dep: libgcc-s1 (>= 3.4) [alpha, amd64, i386, loong64, mips64el, ppc64, riscv64, x32]

  dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]

  dep: libgcc-s1 (>= 4.2) [ia64, sh4]

  dep: libgcc-s1 (>= 4.3) [sparc64]

• dep: libgcc-s2 (>= 4.2.1) [m68k]

  GCC support library

• dep: libgcc-s4 (>= 4.1.1) [hppa]

  GCC support library

• dep: liblz4-1 (>= 0.0~r113)

  Fast LZ compression algorithm library - runtime

• dep: libstdc++6 (>= 13.1) [не arm64, x32]

  GNU Standard C++ Library v3

  dep: libstdc++6 (>= 14) [arm64, x32]

• dep: libunwind8 [ia64]

  library to determine the call-chain of a program - runtime

• dep: zlib1g (>= 1:1.2.3.3)

  compression library - runtime

Изтегляне на hilive

Изтегляне за всички налични архитектури

Архитектура	Версия	Големина на пакета	Големина след инсталиране	Файлове
alpha (неофициална архитектура)	2.0a-4	481,4 кБ	2 824,0 кБ	[списък на файловете]
amd64	2.0a-4	517,9 кБ	2 377,0 кБ	[списък на файловете]
arm64	2.0a-4+b1	476,1 кБ	2 434,0 кБ	[списък на файловете]
armel	2.0a-4	443,7 кБ	2 199,0 кБ	[списък на файловете]
armhf	2.0a-4	457,5 кБ	1 555,0 кБ	[списък на файловете]
hppa (неофициална архитектура)	2.0a-4	474,7 кБ	2 325,0 кБ	[списък на файловете]
i386	2.0a-4	526,7 кБ	2 511,0 кБ	[списък на файловете]
ia64 (неофициална архитектура)	2.0a-3+b3	612,9 кБ	5 084,0 кБ	[списък на файловете]
loong64 (неофициална архитектура)	2.0a-4	491,7 кБ	2 421,0 кБ	[списък на файловете]
m68k (неофициална архитектура)	2.0a-4	385,9 кБ	2 175,0 кБ	[списък на файловете]
mips64el	2.0a-4	472,6 кБ	3 289,0 кБ	[списък на файловете]
ppc64 (неофициална архитектура)	2.0a-4	489,8 кБ	3 137,0 кБ	[списък на файловете]
ppc64el	2.0a-4	502,6 кБ	2 881,0 кБ	[списък на файловете]
riscv64	2.0a-4	526,0 кБ	1 893,0 кБ	[списък на файловете]
s390x	2.0a-4	492,3 кБ	2 453,0 кБ	[списък на файловете]
sh4 (неофициална архитектура)	2.0a-4	452,7 кБ	2 049,0 кБ	[списък на файловете]
sparc64 (неофициална архитектура)	2.0a-4	416,9 кБ	3 151,0 кБ	[списък на файловете]
x32 (неофициална архитектура)	2.0a-4+b1	508,1 кБ	2 308,0 кБ	[списък на файловете]