Pacote: hilive (2.0a-4 e outros)

[ Fonte: hilive  ]

realtime alignment of Illumina reads

HiLive is a read mapping tool that maps Illumina HiSeq (or comparable) reads to a reference genome right in the moment when they are produced. This means, read mapping is finished as soon as the sequencer is finished generating the data.

Outros pacotes relacionados a hilive

• dep: libboost-atomic1.83.0 (>= 1.83.0) [sparc64]

  atomic data types, operations, and memory ordering constraints

• dep: libboost-filesystem1.83.0 (>= 1.83.0)

  filesystem operations (portable paths, iteration over directories, etc) in C++

• dep: libboost-iostreams1.83.0 (>= 1.83.0) [sparc64]

  biblioteca Boost.Iostreams

• dep: libboost-program-options1.83.0 (>= 1.83.0)

  program options library for C++

• dep: libboost-system1.83.0 (>= 1.83.0) [sparc64]

  biblioteca de sistema operacional (e.g. suporte a diagnósticos)

• dep: libc6 (>= 2.37) [sh4]

  GNU Biblioteca C: Bibliotecas compartilhadas
  também um pacote virtual fornecido por libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.38) [não alpha, ia64, sh4]

• dep: libc6.1 (>= 2.34) [alpha]

  GNU Biblioteca C: Bibliotecas compartilhadas
  também um pacote virtual fornecido por libc6.1-udeb

  dep: libc6.1 (>= 2.37) [ia64]

• dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [arm64, ppc64el, s390x]

  Biblioteca de suporte GCC

  dep: libgcc-s1 (>= 3.4) [alpha, amd64, i386, loong64, mips64el, ppc64, riscv64, x32]

  dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]

  dep: libgcc-s1 (>= 4.2) [ia64, sh4]

  dep: libgcc-s1 (>= 4.3) [sparc64]

• dep: libgcc-s2 (>= 4.2.1) [m68k]

  Biblioteca de suporte GCC

• dep: libgcc-s4 (>= 4.1.1) [hppa]

  Biblioteca de suporte GCC

• dep: liblz4-1 (>= 0.0~r113)

  biblioteca de algoritmo de compressão LZ rápido - em tempo de execução

• dep: libstdc++6 (>= 13.1) [não arm64, x32]

  Biblioteca C++ padrão da GNU v3

  dep: libstdc++6 (>= 14) [arm64, x32]

• dep: libunwind8 [ia64]

  biblioteca para determinar a cadeia de chamadas de um programa - execução

• dep: zlib1g (>= 1:1.2.3.3)

  biblioteca de compressão - runtime (tempo de execução)

Download de hilive

Baixe para todas as arquiteturas disponíveis

Arquitetura	Versão	Tamanho do pacote	Tamanho instalado	Arquivos
alpha (porte não oficial)	2.0a-4	481.4 kB	2,824.0 kB	[lista de arquivos]
amd64	2.0a-4	517.9 kB	2,377.0 kB	[lista de arquivos]
arm64	2.0a-4+b1	476.1 kB	2,434.0 kB	[lista de arquivos]
armel	2.0a-4	443.7 kB	2,199.0 kB	[lista de arquivos]
armhf	2.0a-4	457.5 kB	1,555.0 kB	[lista de arquivos]
hppa (porte não oficial)	2.0a-4	474.7 kB	2,325.0 kB	[lista de arquivos]
i386	2.0a-4	526.7 kB	2,511.0 kB	[lista de arquivos]
ia64 (porte não oficial)	2.0a-3+b3	612.9 kB	5,084.0 kB	[lista de arquivos]
loong64 (porte não oficial)	2.0a-4	491.7 kB	2,421.0 kB	[lista de arquivos]
m68k (porte não oficial)	2.0a-4	385.9 kB	2,175.0 kB	[lista de arquivos]
mips64el	2.0a-4	472.6 kB	3,289.0 kB	[lista de arquivos]
ppc64 (porte não oficial)	2.0a-4	489.8 kB	3,137.0 kB	[lista de arquivos]
ppc64el	2.0a-4	502.6 kB	2,881.0 kB	[lista de arquivos]
riscv64	2.0a-4	526.0 kB	1,893.0 kB	[lista de arquivos]
s390x	2.0a-4	492.3 kB	2,453.0 kB	[lista de arquivos]
sh4 (porte não oficial)	2.0a-4	452.7 kB	2,049.0 kB	[lista de arquivos]
sparc64 (porte não oficial)	2.0a-4	416.9 kB	3,151.0 kB	[lista de arquivos]
x32 (porte não oficial)	2.0a-4+b1	508.1 kB	2,308.0 kB	[lista de arquivos]