[ 原始碼： kma ]
套件：kma（1.4.15-1 以及其他的）
mapping genomic sequences to raw reads directly against redundant databases
KMA is mapping a method designed to map raw reads directly against redundant databases, in an ultra-fast manner using seed and extend. KMA is particularly good at aligning high quality reads against highly redundant databases, where unique matches often does not exist. It works for long low quality reads as well, such as those from Nanopore. Non- unique matches are resolved using the "ConClave" sorting scheme, and a consensus sequence are outputtet in addition to other common attributes.
其他與 kma 有關的套件
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- dep: libc6 (>= 2.29) [hppa]
- GNU C 函式庫：共用函式庫
同時作為一個虛擬套件由這些套件填實： libc6-udeb
- dep: libc6 (>= 2.31) [m68k, sh4]
- dep: libc6 (>= 2.34) [除 alpha, hppa, ia64, m68k, sh4]
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- dep: libc6.1 (>= 2.34) [alpha]
- GNU C 函式庫：共用函式庫
同時作為一個虛擬套件由這些套件填實： libc6.1-udeb
- dep: libc6.1 (>= 2.37) [ia64]
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- dep: zlib1g (>= 1:1.1.4)
- 壓縮函式庫 - 跑程式時用(runtime)
下載 kma
| 硬體架構 | 版本 | 套件大小 | 安裝後大小 | 檔案 |
|---|---|---|---|---|
| alpha （非官方移植版） | 1.4.15-1 | 212。8 kB | 799。0 kB | [檔案列表] |
| amd64 | 1.4.15-1 | 214。6 kB | 592。0 kB | [檔案列表] |
| arm64 | 1.4.15-1 | 202。4 kB | 732。0 kB | [檔案列表] |
| hppa （非官方移植版） | 1.3.23-1 | 136。9 kB | 355。0 kB | [檔案列表] |
| ia64 （非官方移植版） | 1.4.14-2 | 258。7 kB | 1，177。0 kB | [檔案列表] |
| m68k （非官方移植版） | 1.3.23-1 | 121。6 kB | 328。0 kB | [檔案列表] |
| mips64el | 1.4.15-1 | 211。9 kB | 824。0 kB | [檔案列表] |
| ppc64 （非官方移植版） | 1.4.15-1 | 224。5 kB | 860。0 kB | [檔案列表] |
| ppc64el | 1.4.15-1 | 228。4 kB | 796。0 kB | [檔案列表] |
| riscv64 | 1.4.15-1 | 231。2 kB | 504。0 kB | [檔案列表] |
| s390x | 1.4.15-1 | 236。3 kB | 684。0 kB | [檔案列表] |
| sh4 （非官方移植版） | 1.3.23-1 | 166。7 kB | 321。0 kB | [檔案列表] |
| sparc64 （非官方移植版） | 1.4.15-1 | 189。3 kB | 3，106。0 kB | [檔案列表] |
| x32 （非官方移植版） | 1.4.15-1 | 170。9 kB | 433。0 kB | [檔案列表] |