[ Källkod: kma ]
Paket: kma (1.4.15-1 och andra)
Länkar för kma
Debianresurser:
Hämta källkodspaketet kma:
Ansvariga:
Externa resurser:
- Hemsida [bitbucket.org]
Liknande paket:
mapping genomic sequences to raw reads directly against redundant databases
KMA is mapping a method designed to map raw reads directly against redundant databases, in an ultra-fast manner using seed and extend. KMA is particularly good at aligning high quality reads against highly redundant databases, where unique matches often does not exist. It works for long low quality reads as well, such as those from Nanopore. Non- unique matches are resolved using the "ConClave" sorting scheme, and a consensus sequence are outputtet in addition to other common attributes.
Andra paket besläktade med kma
|
|
|
|
-
- dep: libc6 (>= 2.29) [hppa]
- GNU C-bibliotek: Delade bibliotek
också ett virtuellt paket som tillhandahålls av libc6-udeb
- dep: libc6 (>= 2.31) [m68k, sh4]
- dep: libc6 (>= 2.34) [ej alpha, hppa, ia64, m68k, sh4]
-
- dep: libc6.1 (>= 2.34) [alpha]
- GNU C-bibliotek: Delade bibliotek
också ett virtuellt paket som tillhandahålls av libc6.1-udeb
- dep: libc6.1 (>= 2.37) [ia64]
-
- dep: zlib1g (>= 1:1.1.4)
- Kompressionsbibliotek - körtidspaket
Hämta kma
| Arkitektur | Version | Paketstorlek | Installerad storlek | Filer |
|---|---|---|---|---|
| alpha (inofficiell anpassning) | 1.4.15-1 | 212,8 kbyte | 799,0 kbyte | [filförteckning] |
| amd64 | 1.4.15-1 | 214,6 kbyte | 592,0 kbyte | [filförteckning] |
| arm64 | 1.4.15-1 | 202,4 kbyte | 732,0 kbyte | [filförteckning] |
| hppa (inofficiell anpassning) | 1.3.23-1 | 136,9 kbyte | 355,0 kbyte | [filförteckning] |
| ia64 (inofficiell anpassning) | 1.4.14-2 | 258,7 kbyte | 1.177,0 kbyte | [filförteckning] |
| m68k (inofficiell anpassning) | 1.3.23-1 | 121,6 kbyte | 328,0 kbyte | [filförteckning] |
| mips64el | 1.4.15-1 | 211,9 kbyte | 824,0 kbyte | [filförteckning] |
| ppc64 (inofficiell anpassning) | 1.4.15-1 | 224,5 kbyte | 860,0 kbyte | [filförteckning] |
| ppc64el | 1.4.15-1 | 228,4 kbyte | 796,0 kbyte | [filförteckning] |
| riscv64 | 1.4.15-1 | 231,2 kbyte | 504,0 kbyte | [filförteckning] |
| s390x | 1.4.15-1 | 236,3 kbyte | 684,0 kbyte | [filförteckning] |
| sh4 (inofficiell anpassning) | 1.3.23-1 | 166,7 kbyte | 321,0 kbyte | [filförteckning] |
| sparc64 (inofficiell anpassning) | 1.4.15-1 | 189,3 kbyte | 3.106,0 kbyte | [filförteckning] |
| x32 (inofficiell anpassning) | 1.4.15-1 | 170,9 kbyte | 433,0 kbyte | [filförteckning] |