套件：cd-hit（4.8.1-4 以及其他的）

cd-hit 的相關連結

Debian 的資源：

下載原始碼套件 cd-hit：

維護小組：

外部的資源：

主頁 [weizhongli-lab.org]

相似套件：

suite of programs designed to quickly group sequences

cd-hit contains a number of programs designed to quickly group sequences. cd-hit groups proteins into clusters that meet a user-defined similarity threshold. cd-hit-est is similar to cd-hit, but designed to group nucleotide sequences (without introns). cd-hit-est-2d is similar to cd-hit-2d but designed to compare two nucleotide datasets. A number of other related programs are also in this package. Please see the cd-hit user manual, also part of this package, for further information.

標籤: 領域: 生物學, 生物資訊學, 實做語言: implemented-in::c++, implemented-in::perl, 使用者介面: 命令行, 角色: role::program, use::comparing, 處理: Biological Sequence

其他與 cd-hit 有關的套件

依賴

推薦

建議

增強

dep: libc6 (>= 2.11) [hppa]

GNU C 函式庫：共用函式庫
同時作為一個虛擬套件由這些套件填實： libc6-udeb

dep: libc6 (>= 2.14) [amd64]

dep: libc6 (>= 2.16) [x32]

dep: libc6 (>= 2.17) [ppc64el]

dep: libc6 (>= 2.31) [sh4]

dep: libc6 (>= 2.34) [riscv64]

dep: libc6 (>= 2.36) [loong64]

dep: libc6 (>= 2.38) [arm64]

dep: libc6 (>= 2.7) [armel, armhf, i386, m68k, mips64el, ppc64, s390x, sparc64]
dep: libc6.1 (>= 2.31) [ia64]

GNU C 函式庫：共用函式庫
同時作為一個虛擬套件由這些套件填實： libc6.1-udeb

dep: libc6.1 (>= 2.7) [alpha]
dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [amd64, arm64, loong64, mips64el, ppc64, ppc64el, s390x, x32]

GCC 支援函式庫

dep: libgcc-s1 (>= 3.4) [alpha, riscv64, sh4, sparc64]

dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]

dep: libgcc-s1 (>= 4.2) [i386, ia64]
dep: libgcc-s2 (>= 4.2.1) [m68k]

GCC 支援函式庫
dep: libgcc-s4 (>= 4.1.1) [hppa]

GCC 支援函式庫
dep: libgomp1 (>= 6)

GCC OpenMP (GOMP) support library
dep: libstdc++6 (>= 13.1) [arm64, riscv64]

GNU Standard C++ Library v3

dep: libstdc++6 (>= 5.2) [除 arm64, riscv64]
dep: libunwind8 [ia64]

library to determine the call-chain of a program - runtime
dep: perl

Larry Wall's Practical Extraction and Report Language
dep: zlib1g (>= 1:1.1.4)

壓縮函式庫 - 跑程式時用(runtime)

下載 cd-hit

下載可用於所有硬體架構的
硬體架構	版本	套件大小	安裝後大小	檔案
alpha （非官方移植版）	4.8.1-4	505。8 kB	1，531。0 kB	[檔案列表]
amd64	4.8.1-4	510。3 kB	1，411。0 kB	[檔案列表]
arm64	4.8.1-4+b1	496。6 kB	1，428。0 kB	[檔案列表]
armel	4.8.1-4	491。0 kB	1，319。0 kB	[檔案列表]
armhf	4.8.1-4	487。6 kB	1，111。0 kB	[檔案列表]
hppa （非官方移植版）	4.8.1-4	506。3 kB	1，398。0 kB	[檔案列表]
i386	4.8.1-4	511。4 kB	1，477。0 kB	[檔案列表]
ia64 （非官方移植版）	4.8.1-4	525。4 kB	2，178。0 kB	[檔案列表]
loong64 （非官方移植版）	4.8.1-4	497。5 kB	1，401。0 kB	[檔案列表]
m68k （非官方移植版）	4.8.1-4	506。1 kB	1，423。0 kB	[檔案列表]
mips64el	4.8.1-4	510。9 kB	1，588。0 kB	[檔案列表]
ppc64 （非官方移植版）	4.8.1-4	509。0 kB	1，813。0 kB	[檔案列表]
ppc64el	4.8.1-4	508。7 kB	1，813。0 kB	[檔案列表]
riscv64	4.8.1-4+b1	505。5 kB	1，236。0 kB	[檔案列表]
s390x	4.8.1-4	496。6 kB	1，429。0 kB	[檔案列表]
sh4 （非官方移植版）	4.8.1-4	510。8 kB	1，373。0 kB	[檔案列表]
sparc64 （非官方移植版）	4.8.1-4	489。5 kB	1，399。0 kB	[檔案列表]
x32 （非官方移植版）	4.8.1-4	506。8 kB	1，381。0 kB	[檔案列表]