软件包：cd-hit（4.8.1-4 以及其他的）

[ 源代码： cd-hit  ]

suite of programs designed to quickly group sequences

cd-hit contains a number of programs designed to quickly group sequences. cd-hit groups proteins into clusters that meet a user-defined similarity threshold. cd-hit-est is similar to cd-hit, but designed to group nucleotide sequences (without introns). cd-hit-est-2d is similar to cd-hit-2d but designed to compare two nucleotide datasets. A number of other related programs are also in this package. Please see the cd-hit user manual, also part of this package, for further information.

标签: 领域: 生物学, 生物信息学, 实做语言: implemented-in::c++, implemented-in::perl, 用户接口: 命令行, 角色: role::program, use::comparing, 处理: Biological Sequence

其他与 cd-hit 有关的软件包

• dep: libc6 (>= 2.11) [hppa]

  GNU C 语言运行库：共享库
  同时作为一个虚包由这些包填实： libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.14) [amd64]

  dep: libc6 (>= 2.16) [x32]

  dep: libc6 (>= 2.17) [ppc64el]

  dep: libc6 (>= 2.31) [sh4]

  dep: libc6 (>= 2.34) [riscv64]

  dep: libc6 (>= 2.36) [loong64]

  dep: libc6 (>= 2.38) [arm64]

  dep: libc6 (>= 2.7) [armel, armhf, i386, m68k, mips64el, ppc64, s390x, sparc64]

• dep: libc6.1 (>= 2.31) [ia64]

  GNU C 语言运行库：共享库
  同时作为一个虚包由这些包填实： libc6.1-udeb

  dep: libc6.1 (>= 2.7) [alpha]

• dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [amd64, arm64, loong64, mips64el, ppc64, ppc64el, s390x, x32]

  GCC 支持库

  dep: libgcc-s1 (>= 3.4) [alpha, riscv64, sh4, sparc64]

  dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]

  dep: libgcc-s1 (>= 4.2) [i386, ia64]

• dep: libgcc-s2 (>= 4.2.1) [m68k]

  GCC 支持库

• dep: libgcc-s4 (>= 4.1.1) [hppa]

  GCC 支持库

• dep: libgomp1 (>= 6)

  GCC OpenMP（GOMP）支持库

• dep: libstdc++6 (>= 13.1) [arm64, riscv64]

  GNU 标准 C++ 库，第3版

  dep: libstdc++6 (>= 5.2) [除 arm64, riscv64]

• dep: libunwind8 [ia64]

  library to determine the call-chain of a program - runtime

• dep: perl

  拉里 沃尔的实用报表提取语言(Perl)

• dep: zlib1g (>= 1:1.1.4)

  压缩库 - 运行时

下载 cd-hit

下载可用于所有硬件架构的

硬件架构	版本	软件包大小	安装后大小	文件
alpha （非官方移植版）	4.8.1-4	505.8 kB	1,531.0 kB	[文件列表]
amd64	4.8.1-4	510.3 kB	1,411.0 kB	[文件列表]
arm64	4.8.1-4+b1	496.6 kB	1,428.0 kB	[文件列表]
armel	4.8.1-4	491.0 kB	1,319.0 kB	[文件列表]
armhf	4.8.1-4	487.6 kB	1,111.0 kB	[文件列表]
hppa （非官方移植版）	4.8.1-4	506.3 kB	1,398.0 kB	[文件列表]
i386	4.8.1-4	511.4 kB	1,477.0 kB	[文件列表]
ia64 （非官方移植版）	4.8.1-4	525.4 kB	2,178.0 kB	[文件列表]
loong64 （非官方移植版）	4.8.1-4	497.5 kB	1,401.0 kB	[文件列表]
m68k （非官方移植版）	4.8.1-4	506.1 kB	1,423.0 kB	[文件列表]
mips64el	4.8.1-4	510.9 kB	1,588.0 kB	[文件列表]
ppc64 （非官方移植版）	4.8.1-4	509.0 kB	1,813.0 kB	[文件列表]
ppc64el	4.8.1-4	508.7 kB	1,813.0 kB	[文件列表]
riscv64	4.8.1-4+b1	505.5 kB	1,236.0 kB	[文件列表]
s390x	4.8.1-4	496.6 kB	1,429.0 kB	[文件列表]
sh4 （非官方移植版）	4.8.1-4	510.8 kB	1,373.0 kB	[文件列表]
sparc64 （非官方移植版）	4.8.1-4	489.5 kB	1,399.0 kB	[文件列表]
x32 （非官方移植版）	4.8.1-4	506.8 kB	1,381.0 kB	[文件列表]