Paketti: cd-hit (4.8.1-4 ja muut)

[ Source: cd-hit  ]

suite of programs designed to quickly group sequences

cd-hit contains a number of programs designed to quickly group sequences. cd-hit groups proteins into clusters that meet a user-defined similarity threshold. cd-hit-est is similar to cd-hit, but designed to group nucleotide sequences (without introns). cd-hit-est-2d is similar to cd-hit-2d but designed to compare two nucleotide datasets. A number of other related programs are also in this package. Please see the cd-hit user manual, also part of this package, for further information.

Tagit: Field: Biology, Bioinformatics, Implemented in: implemented-in::c++, implemented-in::perl, User Interface: Command Line, Role: role::program, use::comparing, Works with: Biological Sequence

Muut pakettiin cd-hit liittyvät paketit

• dep: libc6 (>= 2.11) [hppa]

  GNU-C-kirjasto: jaetut kirjastot
  myös näennäispaketti, jonka toteuttaa libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.14) [amd64]

  dep: libc6 (>= 2.16) [x32]

  dep: libc6 (>= 2.17) [ppc64el]

  dep: libc6 (>= 2.31) [sh4]

  dep: libc6 (>= 2.34) [riscv64]

  dep: libc6 (>= 2.38) [arm64]

  dep: libc6 (>= 2.7) [armel, armhf, i386, m68k, mips64el, ppc64, s390x, sparc64]

• dep: libc6.1 (>= 2.31) [ia64]

  GNU-C-kirjasto: jaetut kirjastot
  myös näennäispaketti, jonka toteuttaa libc6.1-udeb

  dep: libc6.1 (>= 2.7) [alpha]

• dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [amd64, arm64, mips64el, ppc64, ppc64el, s390x, x32]

  GCC:n apukirjasto

  dep: libgcc-s1 (>= 3.4) [alpha, riscv64, sh4, sparc64]

  dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]

  dep: libgcc-s1 (>= 4.2) [i386, ia64]

• dep: libgcc-s2 (>= 4.2.1) [m68k]

  GCC:n apukirjasto

• dep: libgcc-s4 (>= 4.1.1) [hppa]

  GCC:n apukirjasto

• dep: libgomp1 (>= 6)

  GCC OpenMP (GOMP) support library

• dep: libstdc++6 (>= 13.1) [arm64, riscv64]

  GNU standardi C++ -kirjasto, versio 3

  dep: libstdc++6 (>= 5.2) [ei arm64, riscv64]

• dep: libunwind8 [ia64]

  library to determine the call-chain of a program - runtime

• dep: perl

  Larry Wallin kieli tekstitiedostojen analysointia ja raportointia varten

• dep: zlib1g (>= 1:1.1.4)

  pakkauskirjaston ajonaikaistiedostot

Imuroi cd-hit

Imurointi kaikille saataville arkkitehtuureille

Arkkitehtuuri	Versio	Paketin koko	Koko asennettuna	Tiedostot
alpha (epävirallinen siirros)	4.8.1-4	505.8 kt	1,531.0 kt	[tiedostoluettelo]
amd64	4.8.1-4	510.3 kt	1,411.0 kt	[tiedostoluettelo]
arm64	4.8.1-4+b1	496.6 kt	1,428.0 kt	[tiedostoluettelo]
armel	4.8.1-4	491.0 kt	1,319.0 kt	[tiedostoluettelo]
armhf	4.8.1-4	487.6 kt	1,111.0 kt	[tiedostoluettelo]
hppa (epävirallinen siirros)	4.8.1-4	506.3 kt	1,398.0 kt	[tiedostoluettelo]
i386	4.8.1-4	511.4 kt	1,477.0 kt	[tiedostoluettelo]
ia64 (epävirallinen siirros)	4.8.1-4	525.4 kt	2,178.0 kt	[tiedostoluettelo]
m68k (epävirallinen siirros)	4.8.1-4	506.1 kt	1,423.0 kt	[tiedostoluettelo]
mips64el	4.8.1-4	510.9 kt	1,588.0 kt	[tiedostoluettelo]
ppc64 (epävirallinen siirros)	4.8.1-4	509.0 kt	1,813.0 kt	[tiedostoluettelo]
ppc64el	4.8.1-4	508.7 kt	1,813.0 kt	[tiedostoluettelo]
riscv64	4.8.1-4+b1	505.5 kt	1,236.0 kt	[tiedostoluettelo]
s390x	4.8.1-4	496.6 kt	1,429.0 kt	[tiedostoluettelo]
sh4 (epävirallinen siirros)	4.8.1-4	510.8 kt	1,373.0 kt	[tiedostoluettelo]
sparc64 (epävirallinen siirros)	4.8.1-4	489.5 kt	1,399.0 kt	[tiedostoluettelo]
x32 (epävirallinen siirros)	4.8.1-4	506.8 kt	1,381.0 kt	[tiedostoluettelo]