Пакет: probalign (1.4-10)

[ Источник: probalign  ]

multiple sequence alignment using partition function posterior probabilities

Probalign uses partition function posterior probability estimates to compute maximum expected accuracy multiple sequence alignments. It performs statistically significantly better than the leading alignment programs Probcons v1.1, MAFFT v5.851, and MUSCLE v3.6 on BAliBASE 3.0, HOMSTRAD, and OXBENCH benchmarks. Probalign improvements are largest on datasets containing N/C terminal extensions and on datasets with long and heterogeneous length sequences. On heteregeneous length datasets containing repeats Probalign alignment accuracy is 10% and 15% higher than the other three methods when standard deviation of length is at least 300 and 400.

Другие пакеты, относящиеся к probalign

• dep: libc6 (>= 2.34)

  библиотека GNU C: динамически подключаемые библиотеки
  также виртуальный пакет, предоставляемый libc6-udeb

• dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [не armel, armhf, ppc64el]

  вспомогательная библиотека GCC

  dep: libgcc-s1 (>= 3.4.4) [ppc64el]

  dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]

• dep: libstdc++6 (>= 11)

  стандартная библиотека GNU C++ версии 3

Загрузка probalign

Загрузить для всех доступных архитектур

Архитектура	Размер пакета	В установленном виде	Файлы
amd64	68,9 Кб	175,0 Кб	[список файлов]
arm64	64,6 Кб	219,0 Кб	[список файлов]
armel	55,1 Кб	142,0 Кб	[список файлов]
armhf	53,9 Кб	114,0 Кб	[список файлов]
i386	61,4 Кб	158,0 Кб	[список файлов]
mips64el	65,4 Кб	223,0 Кб	[список файлов]
ppc64el	78,4 Кб	219,0 Кб	[список файлов]
s390x	56,7 Кб	171,0 Кб	[список файлов]