Package: probalign (1.4-10 and others)

[ Source: probalign  ]

allineamento di sequenze multiple usando le probabilità a posteriori della funzione di ripartizione

Probalign usa stime della probabilità a posteriori della funzione di ripartizione per calcolare allineamenti di sequenze multiple con la massima accuratezza attesa. Funziona in modo migliore rispetto ai programmi di allineamento più usati Probcons v1.1, MAFFT v5.851 e MUSCLE v3.6 nei test di prestazione BAliBASE 3.0, HOMSTRAD e OXBENCH, e tale miglioramento è statisticamente significativo. I miglioramenti di Probalign sono maggiori negli insiemi di dati che contengono estensioni terminali N/C e in quelli con sequenze di lunghezze elevate ed eterogenee. Negli insiemi di dati con lunghezze eterogenee contenenti ripetizioni, l'accuratezza degli allineamenti di Probalign è del 10% e il 15% maggiore rispetto agli altri tre metodi, quando la deviazione standard della lunghezza è almeno 300 e 400.

Other Packages Related to probalign

• dep: libc6 (>= 2.34) [not arm64]

  Libreria C GNU: librerie condivise
  also a virtual package provided by libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.38) [arm64]

• dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [not armel, armhf, ppc64el]

  libreria di supporto a GCC

  dep: libgcc-s1 (>= 3.4.4) [ppc64el]

  dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]

• dep: libstdc++6 (>= 11) [not arm64, riscv64]

  libreria GNU Standard C++, versione 3

  dep: libstdc++6 (>= 13.1) [arm64, riscv64]

Download probalign

Download for all available architectures

Architecture	Version	Package Size	Installed Size	Files
amd64	1.4-10	68.9 kB	175.0 kB	[list of files]
arm64	1.4-10+b1	66.9 kB	220.0 kB	[list of files]
armel	1.4-10	55.1 kB	142.0 kB	[list of files]
armhf	1.4-10	53.9 kB	114.0 kB	[list of files]
i386	1.4-10	61.4 kB	158.0 kB	[list of files]
mips64el	1.4-10	65.4 kB	223.0 kB	[list of files]
ppc64el	1.4-10	78.4 kB	219.0 kB	[list of files]
riscv64	1.4-10+b1	67.4 kB	132.0 kB	[list of files]
s390x	1.4-10	56.7 kB	171.0 kB	[list of files]