Пакунок: khmer (2.1.2+dfsg-6)

[ Source: khmer  ]

in-memory DNA sequence kmer counting, filtering & graph traversal

khmer is a library and suite of command line tools for working with DNA sequence. It is primarily aimed at short-read sequencing data such as that produced by the Illumina platform. khmer takes a k-mer-centric approach to sequence analysis, hence the name.

Tags: Biology: Fasta/Pearson, Nucleic Acids, Field: field::biology, field::biology:bioinformatics, Implemented in: implemented-in::c++, implemented-in::python, User Interface: Command Line, Role: role::program, use::analysing, Purpose: Comparing, Filtering

Інші пакунки пов'язані з khmer

• dep: cython3 (>= 0.26.1)

  C-Extensions for Python 3

• dep: khmer-common

  common files for the khmer project tools

• dep: libbz2-1.0

  Стискання файлів за алгоритмом Барроуза-Уїлера — виконавчий модуль

• dep: libc6 (>= 2.14) [amd64]

  Бібліотека GNU C: спільні бібліотеки
  also a virtual package provided by libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.17) [arm64]

• dep: libgcc1 (>= 1:3.0) [arm64]

  Допоміжна бібліотека GCC

  dep: libgcc1 (>= 1:3.4) [amd64]

• dep: libgomp1 (>= 4.9)

  Підтримувальна бібліотека GCC OpenMP (GOMP)

• dep: libstdc++6 (>= 5.2)

  Стандартна бібліотека C++ GNU, версії 3

• dep: python3

  Інтерактивна об'єктно-орієнтована мова високого рівня (типова версія „python3“)

  dep: python3 (<< 3.8)

  dep: python3 (>= 3.7~)

• dep: python3-bz2file

  Python3 library for reading and writing bzip2-compressed files

• dep: python3-screed (>= 1.0)

  short nucleotide read sequence utils in Python 3

• dep: zlib1g (>= 1:1.2.3.4)

  Бібліотека стискання даних (виконавчий модуль)

Завантажити khmer

Завантаження для всіх доступних архітектур

Архітектура	Розмір пакунка	Розмір після встановлення	Файли
amd64	6,488.5 kB	29,563.0 kB	[список файлів]
arm64	6,408.0 kB	29,286.0 kB	[список файлів]