[ Kaynak: umis ]
Paket: umis (1.0.8-3 ve diğerleri)
umis için bağlantılar
Debian Kaynakları:
- Hata Raporları
- Developer Information
- Debian Değişim Günlüğü
- Telif Hakkı Dosyası
- Debian Yama Takipçisi
umis Kaynak Paketini İndir:
Geliştiriciler:
Dış Kaynaklar:
- Ana Sayfa [github.com]
Benzer paketler:
tools for processing UMI RNA-tag data
Umis provides tools for estimating expression in RNA-Seq data which performs sequencing of end tags of transcript, and incorporate molecular tags to correct for amplification bias.
There are four steps in this process.
1. Formatting reads 2. Filtering noisy cellular barcodes 3. Pseudo-mapping to cDNAs 4. Counting molecular identifiers
umis ile İlgili Diğer Paketler
|
|
|
|
-
- dep: libc6 (>= 2.17)
- GNU C Library: Shared libraries
ayrıca şunun tarafından sağlanan bir sanal paket libc6-udeb
-
- dep: python3
- interactive high-level object-oriented language (default python3 version)
- dep: python3 (<< 3.12)
- dep: python3 (>= 3.11~)
-
- dep: python3-click
- Wrapper around optparse for command line utilities - Python 3.x
-
- dep: python3-pandas
- data structures for "relational" or "labeled" data
-
- dep: python3-pysam
- interface for the SAM/BAM sequence alignment and mapping format (Python 3)
-
- dep: python3-regex
- alternative regular expression module (Python 3)
-
- dep: python3-scipy
- scientific tools for Python 3
-
- dep: python3-toolz
- List processing tools and functional utilities
-
- sug: umis-examples
- tools for processing UMI RNA-tag data (examples)
umis indir
Mimari | Sürüm | Paket Boyutu | Kurulu Boyut | Dosyalar |
---|---|---|---|---|
arm64 | 1.0.8-3+b1 | 25,6 kB | 157,0 kB | [dosya listesi] |