Paket: hinge (0.5.0-2) [debports]

[ Källkod:  ]

long read genome assembler based on hinging

HINGE is a genome assembler that seeks to achieve optimal repeat resolution by distinguishing repeats that can be resolved given the data from those that cannot. This is accomplished by adding “hinges” to reads for constructing an overlap graph where only unresolvable repeats are merged. As a result, HINGE combines the error resilience of overlap-based assemblers with repeat-resolution capabilities of de Bruijn graph assemblers.

Andra paket besläktade med hinge

• dep: daligner

  local alignment discovery between long nucleotide sequencing reads

• dep: dascrubber

  alignment-based scrubbing pipeline for DNA sequencing reads

• dep: dazzdb

  manage nucleotide sequencing read data

• dep: libc6 (>= 2.7)

  GNU C-bibliotek: Delade bibliotek
  också ett virtuellt paket som tillhandahålls av libc6-udeb

• dep: libgcc1 (>= 1:3.0)

  Paketet inte tillgängligt

• dep: libgomp1 (>= 4.2.1)

  GCC OpenMP (GOMP) support library

• dep: libstdc++6 (>= 5.2)

  GNU standardbibliotek v3 för C++

• dep: python

  Paketet inte tillgängligt

• dep: python-colormap

  Paketet inte tillgängligt

• dep: python-configparser

  Paketet inte tillgängligt

• dep: python-matplotlib

  Paketet inte tillgängligt

• dep: python-networkx

  Paketet inte tillgängligt

• dep: python-numpy

  Paketet inte tillgängligt

• dep: python-pbcore

  virtuellt paket som tillhandahålls av python3-pbcore

• dep: python-ujson

  Paketet inte tillgängligt

• dep: zlib1g (>= 1:1.1.4)

  Kompressionsbibliotek - körtidspaket

Hämta hinge

Hämtningar för alla tillgängliga arkitekturer

Arkitektur	Paketstorlek	Installerad storlek	Filer
ppc64 (inofficiell anpassning)	367,3 kbyte	3.140,0 kbyte	[filförteckning]