Paquet : hinge (0.5.0-2) [debports]

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assembleur de lectures longues de génome basé sur des « pivots »

HINGE est un « assembleur » pour le génome qui cherche à réaliser une résolution optimale des répétitions en distinguant les répétitions qui peuvent être résolues pour des données de celles qui ne le peuvent pas. Cela est obtenu en ajoutant des « charnières » (hinge) aux lectures pour construire un graphe de chevauchements où les répétitions non résolues sont fusionnées. Au final, HINGE combine la résilience aux erreurs des assembleurs basés sur les chevauchements avec les capacités de résolution de répétitions des assembleurs basés sur les graphes de de Bruijn.

Autres paquets associés à hinge

• dep: daligner

  alignements locaux parmi des lectures longues de séquençages de nucléotide

• dep: dascrubber

  alignment-based scrubbing pipeline for DNA sequencing reads

• dep: dazzdb

  manage nucleotide sequencing read data

• dep: libc6 (>= 2.7)

  bibliothèque C GNU : bibliothèques partagées
  un paquet virtuel est également fourni par libc6-udeb

• dep: libgcc1 (>= 1:3.0)

  Paquet indisponible

• dep: libgomp1 (>= 4.2.1)

  bibliothèque GCC pour OpenMP (GOMP)

• dep: libstdc++6 (>= 5.2)

  bibliothèque standard C++ de GNU v3

• dep: python

  Paquet indisponible

• dep: python-colormap

  Paquet indisponible

• dep: python-configparser

  Paquet indisponible

• dep: python-matplotlib

  Paquet indisponible

• dep: python-networkx

  Paquet indisponible

• dep: python-numpy

  Paquet indisponible

• dep: python-pbcore

  paquet virtuel fourni par python3-pbcore

• dep: python-ujson

  Paquet indisponible

• dep: zlib1g (>= 1:1.1.4)

  Bibliothèque de compression - binaires

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Architecture	Taille du paquet	Espace occupé une fois installé	Fichiers
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